CALCOCO1 - CALCOCO1

CALCOCO1
Идентификаторы
Псевдонимы	CALCOCO1, Какао, кальфоглин, PP13275, связывание кальция и домен 1 спиральной спирали
Внешние идентификаторы	MGI: 1914738 ГомолоГен: 10845 Генные карты: CALCOCO1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12q13.13 Начните 53,708,517 бп[1] Конец 53,727,745 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 15 (мышь)[2] Группа 15 F3 | 15 Начните 102,706,777 бп[2] Конец 102,722,178 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • последовательное связывание ДНК • связывание бета-катенина • GO: 0001105 активность коактиватора транскрипции • связывание хроматина • GO: 0001104 активность корегулятора транскрипции • связывание с С-концом белка • GO: 0001948 связывание с белками • коактиватор транскрипции лиганд-зависимого ядерного рецептора • Связывание с повторным доменом броненосца • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II Сотовый компонент • внутриклеточная мембраносвязанная органелла • ядерный хроматин • ядро клетки • цитоплазма • цитозоль Биологический процесс • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • сигнальный путь внутриклеточного рецептора стероидного гормона • Сигнальный путь Wnt • транскрипция, ДНК-шаблон • положительная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • преобразование сигнала • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • положительная регуляция экспрессии генов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	57658	67488
Ансамбль	ENSG00000012822	ENSMUSG00000023055
UniProt	Q9P1Z2	Q8CGU1
RefSeq (мРНК)	NM_001143682 NM_020898	NM_026192
RefSeq (белок)	NP_001137154 NP_065949	NP_080468
Расположение (UCSC)	Chr 12: 53.71 - 53.73 Мб	Chr 15: 102,71 - 102,72 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Кальций-связывающий белок 1, содержащий домен спиральной спирали это белок что у людей кодируется CALCOCO1 ген.^[5][6][7]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000012822 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000023055 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Нагасе Т., Кикуно Р., Исикава К., Хиросава М., Охара О. (сентябрь 2000 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XVII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 7 (2): 143–50. Дои:10.1093 / dnares / 7.2.143. PMID  10819331.
6. Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Bocher M, Blocker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Dusterhoft A, Beyer A, Kohrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwalder B , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Поустка А. (март 2001 г.). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
7. «Ген Entrez: связывание кальция и домен 1 спиральной спирали CALCOCO1».

внешние ссылки

• Человек CALCOCO1 расположение генома и CALCOCO1 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Симпсон Дж. К., Велленройтер Р., Поустка А. и др. (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO Rep. 1 (3): 287–92. Дои:10.1093 / embo-reports / kvd058. ЧВК  1083732. PMID  11256614.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ли С.Ю., Обата Ю., Йошида М. и др. (2003). «Иммуномический анализ саркомы человека». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 100 (5): 2651–6. Дои:10.1073 / pnas.0437972100. ЧВК  151395. PMID  12601173.
• Кларк Х.Ф., Герни А.Л., Абая Э. и др. (2003). «Инициатива по открытию секретных белков (SPDI), широкомасштабное усилие по идентификации новых секретируемых человеком и трансмембранных белков: оценка биоинформатики». Genome Res. 13 (10): 2265–70. Дои:10.1101 / гр.1293003. ЧВК  403697. PMID  12975309.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Такахаши К., Инузука М., Инги Т. (2005). «Передача клеточных сигналов, опосредованная кальфоглином-индуцированной активацией IPP и PGM». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 325 (1): 203–14. Дои:10.1016 / j.bbrc.2004.10.021. PMID  15522220.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Ян С.К., Ким Дж. Х., Ли Х, Сталлкап MR (2006). «Дифференциальное использование функциональных доменов CoCoA в его синергической коактиваторной функции с β-катенином или GRIP1». J. Biol. Chem. 281 (6): 3389–97. Дои:10.1074 / jbc.M510403200. ЧВК  1626527. PMID  16344550.
• Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.
• Лим Дж., Хао Т., Шоу С. и др. (2006). «Сеть белок-белкового взаимодействия для унаследованных атаксий человека и нарушений дегенерации клеток Пуркинье». Ячейка. 125 (4): 801–14. Дои:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID  16713569. S2CID  13709685.
• Ян С.К., Ким Дж. Х., Сталлкап MR (2007). «Роль N-концевого домена активации коактиватора CoCoA в опосредовании активации транскрипции β-катенином». Мол. Эндокринол. 20 (12): 3251–62. Дои:10.1210 / me.2006-0200. ЧВК  1770943. PMID  16931570.