Дэвид М. Книп - David M. Knipe

Дэвид М. Книп
Родился
Ланкастер, Огайо
НациональностьСоединенные Штаты
ГражданствоАмериканец
Альма-матерКейс Вестерн Резервный университет Б.А.
Массачусетский Институт Технологий Кандидат наук.
Чикагский университет Постдокторантура
ИзвестенВирус простого герпеса исследование
Области вирусологии
Научная карьера
ПоляВирусология
Микробиология
Иммунобиология
УчрежденияГарвардская медицинская школа

Дэвид М. Книп Хиггинс профессор Микробиология и Молекулярная генетика и исполняющий обязанности сопредседателя кафедры микробиологии и Иммунобиология на Гарвардская медицинская школа в Бостон, Массачусетс[1] и со-главный редактор справочника Области вирусологии.[2] Ранее он работал председателем программы в Вирусология в Гарвардской медицинской школе с 2004 по 2016 год.

Образование

Книп получил образование в Кейс Вестерн Резервный университет, получив степень бакалавра искусств с отличием в биология в 1972 году. В CWRU он проводил исследования с Д-р Роберт Д. Гольдман и показали, что микрофиламенты в клетках млекопитающих актин нитей за счет связывания очищенных тяжелых меромиозин для украшения микрофиламентов в проницаемых клетках.[3] Он продолжил занятия по клеточной биологии в Массачусетский Институт Технологий, получив докторскую степень. в 1976 г .; его диссертационное исследование было сосредоточено на вирус везикулярного стоматита (VSV) под присмотром Д-р Дэвид Балтимор и Доктор Харви Лодиш. Книп первым отделил и перевел VSV мРНК in vitro для определения их кодирующего потенциала. Затем он показал, что VSV гликопротеин (G) и мембранные (М) белки собраны в вирионы двумя отдельными путями. Путь для G-белка помог определить секреторный путь сборки мембранных гликопротеинов, а путь для M-белка определил цитозольный путь сборки мембранного белка.[4][5][6][7]

После завершения учебы в аспирантуре он получил докторскую степень по молекулярной генетике вирус простого герпеса (HSV) на Чикагский университет с участием Д-р Бернард Ройзман. Книп разработал котрансфекция метод картирования мутаций и введения новых последовательностей в геном HSV и показал, что ген ICP4 картирован в повторяющихся последовательностях короткого компонента вирусного генома.[8] Эта методология была использована для картирования вирусных гликопротеинов, морфологии бляшек и маркеров лекарственной устойчивости, а также для создания кандидатной вакцины против генитального герпеса.[9]

Исследование

В 1979 году Книп поступил на факультет Гарвардской медицинской школы в качестве доцента микробиологии и молекулярной генетики и основал свою собственную лабораторию для изучения HSV. Он показал, что ВПГ реплицирует свою ДНК в определенных отделах ядра инфицированной клетки.[10][11] Они также показали, что вирусный геном, связанный с ядерная пластинка для немедленной ранней транскрипции. Эта работа показала, что внутриядерные белки локализуются в определенных сайтах для выполнения своих функций, так же как цитоплазматические белки, как известно, локализуются в определенных сайтах. Это привело к появлению новых областей изучения внутриядерной компартментализации репликации ДНК-вируса. Исследование Книпа показало, что белки репарации и рекомбинации ДНК клетки-хозяина локализованы в компартментах репликации вируса и что некоторые из них подавляют репликацию вируса, а некоторые необходимы для репликации вируса.[12] Он открыл молекулярную основу литической и латентной инфекции вируса простого герпеса посредством определения эпигенетических регуляторных механизмов, в которых: вирусные белки способствуют модификации эухроматина на вирусном хроматине и транскрипции литических генов в эпителиальных клетках; и связанный с вирусной латентностью транскрипт способствует модификации гетерохроматина на вирусном хроматине и подавлению литических генов в нейронах.[13][14][15] Он определил структуру вирусного хроматина во время латентной инфекции нейронов и механизмы, с помощью которых вирусная ДНК подавляется во время латентной инфекции.[16][17][18] Он также определил клеточные белки, которые распознают герпесвирусную ДНК в ядре, инициируют врожденную передачу сигналов и ограничивают экспрессию вирусных генов, и идентифицировал вирусные белки, которые блокируют врожденные ответы хозяина.[19][20][21][22] Его работа показала, что вирусы с дефектной репликацией могут служить вакциной против генитального герпеса и вектором вакцины - одной из этих вакцин против генитального герпеса, HSV-529, является ведущим кандидатом в клинических испытаниях фазы I.[9][23][24]

Награды и отличия

Книп получил несколько наград и наград, в том числе:

Личная жизнь

Книп женат на Сюзанне Книп; у них две дочери и трое внуков.

использованная литература

  1. ^ «Кафедра микробиологии и иммунобиологии | Факультет и их исследования». Получено 15 января, 2015.
  2. ^ «Полевая вирусология». Получено 15 января, 2015.
  3. ^ Goldman, R.D .; Книп, Д. М. (1973). «Функции цитоплазматических волокон в подвижности немышечных клеток». Симпозиумы Колд-Спринг-Харбор по количественной биологии. 37: 523–534. Дои:10.1101 / sqb.1973.037.01.063.
  4. ^ Knipe, D. M .; Lodish, H. F .; Балтимор, Д. (1977). «Локализация двух клеточных форм вирусного гликопротеина везикулярного стоматита». Журнал вирусологии. 21 (3): 1121–1127. ЧВК  515653. PMID  191639.
  5. ^ Knipe, D. M .; Балтимор, Д .; Лодиш, Х. Ф. (1977). «Отдельные пути созревания основных структурных белков вируса везикулярного стоматита». Журнал вирусологии. 21 (3): 1128–1139. ЧВК  515654. PMID  191640.
  6. ^ Knipe, D. M .; Lodish, H. F .; Балтимор, Д. (1977). «Анализ дефектов термочувствительных мутантов вируса везикулярного стоматита: внутриклеточная деградация специфических вирусных белков». Журнал вирусологии. 21 (3): 1140–1148. ЧВК  515655. PMID  191641.
  7. ^ Knipe, D. M .; Балтимор, Д .; Лодиш, Х. Ф. (1977). «Созревание вирусных белков в клетках, инфицированных термочувствительными мутантами вируса везикулярного стоматита». Журнал вирусологии. 21 (3): 1149–1158. ЧВК  515656. PMID  191642.
  8. ^ Knipe, D. M .; Ruyechan, W. T .; Ройзман, Б .; Халлибертон, И. В. (1978). «Молекулярная генетика вируса простого герпеса: демонстрация областей обязательной и необязательной идентичности в диплоидных областях генома путем замены и вставки последовательности». Труды Национальной академии наук. 75 (8): 3896–3900. Дои:10.1073 / пнас.75.8.3896. ISSN  0027-8424. ЧВК  392895. PMID  211508.
  9. ^ а б Да Коста, X.J .; Jones, C.A .; Книп, Д. М. (1999). «Иммунизация против генитального герпеса вакцинным вирусом, имеющим дефекты продуктивной и латентной инфекции». Труды Национальной академии наук. 96 (12): 6994–6998. Дои:10.1073 / пнас.96.12.6994. ISSN  0027-8424. ЧВК  22033. PMID  10359827.
  10. ^ Куинлан, Маргарет П .; Чен, Лан Бо; Книп, Дэвид М. (1984). «Внутриядерное расположение ДНК-связывающего белка вируса простого герпеса определяется статусом репликации вирусной ДНК». Ячейка. 36 (4): 857–868. Дои:10.1016/0092-8674(84)90035-7. ISSN  0092-8674.
  11. ^ Копс, Энн де Брюн; Книп, Дэвид М. (1988). «Для образования структур репликации ДНК в клетках, инфицированных вирусом герпеса, требуется белок, связывающий вирусную ДНК». Ячейка. 55 (5): 857–868. Дои:10.1016/0092-8674(88)90141-9. ISSN  0092-8674.
  12. ^ Тейлор, Т. Дж .; Книп, Д. М. (2004). "Протеомика репликационных отделов вируса простого герпеса: ассоциация белков репликации, восстановления, рекомбинации и ремоделирования хроматина клеточной ДНК с ICP8". Журнал вирусологии. 78 (11): 5856–5866. Дои:10.1128 / JVI.78.11.5856-5866.2004. ISSN  0022-538X. ЧВК  415816. PMID  15140983.
  13. ^ Wang, Q.-Y .; Чжоу, C .; Johnson, K. E .; Colgrove, R.C .; Coen, D. M .; Книп, Д. М. (2005). «Ген транскрипта, связанный с латентным вирусом герпеса, способствует сборке гетерохроматина на промоторах вирусного литического гена при латентной инфекции». Труды Национальной академии наук. 102 (44): 16055–16059. Дои:10.1073 / pnas.0505850102. ISSN  0027-8424. ЧВК  1266038. PMID  16247011.
  14. ^ Клифф, А. Р .; Книп, Д. М. (2008). «Вирус простого герпеса ICP0 способствует как удалению гистонов, так и ацетилированию вирусной ДНК во время литической инфекции». Журнал вирусологии. 82 (24): 12030–12038. Дои:10.1128 / JVI.01575-08. ISSN  0022-538X. ЧВК  2593313. PMID  18842720.
  15. ^ Книп, Дэвид М .; Клифф, Анна (2008). "Контроль хроматина литической и латентной инфекции вируса простого герпеса". Обзоры природы Микробиология. 6 (3): 211–221. Дои:10.1038 / nrmicro1794. ISSN  1740-1526. PMID  18264117.
  16. ^ Клифф, А. Р .; Гарбер, Д. А .; Книп, Д. М. (2009). «Транскрипция транскрипта, связанного с латентностью вируса простого герпеса, способствует образованию факультативного гетерохроматина на литических промоторах». Журнал вирусологии. 83 (16): 8182–8190. Дои:10.1128 / JVI.00712-09. ISSN  0022-538X. ЧВК  2715743. PMID  19515781.
  17. ^ Клифф, А. Р .; Coen, D. M .; Книп, Д. М. (2013). «Кинетика факультативной ассоциации белков гетерохроматина и группы Polycomb с геномом вируса простого герпеса при установлении скрытой инфекции» (PDF). мБио. 4 (1): e00590-12 – e00590-12. Дои:10,1128 / мBio.00590-12. ISSN  2150-7511.
  18. ^ Книп, Дэвид М .; Либерман, Пол М .; Jung, Jae U .; McBride, Alison A .; Моррис, Кевин В .; Отт, Мелани; Марголис, Дэвид; Ньето, Амелия; Невелс, Майкл; Парки, Робин Дж .; Кристи, Томас М. (2013). «Снимки: хроматиновый контроль вирусной инфекции». Вирусология. 435 (1): 141–156. Дои:10.1016 / j.virol.2012.09.023. ISSN  0042-6822. ЧВК  3531885. PMID  23217624.
  19. ^ Орзалли, М. Х .; DeLuca, N.A .; Книп, Д. М. (2012). «Ядерная индукция IFI16 передачи сигналов IRF-3 во время герпесвирусной инфекции и деградация IFI16 вирусным белком ICP0». Труды Национальной академии наук. 109 (44): E3008 – E3017. Дои:10.1073 / pnas.1211302109. ISSN  0027-8424. ЧВК  3497734. PMID  23027953.
  20. ^ Орзалли, М. Х .; Conwell, S.E .; Berrios, C .; DeCaprio, J.A .; Книп, Д. М. (2013). «Ядерный интерферон-индуцируемый белок 16 способствует подавлению герпесвирусной и трансфицированной ДНК». Труды Национальной академии наук. 110 (47): E4492 – E4501. Дои:10.1073 / pnas.1316194110. ISSN  0027-8424. ЧВК  3839728. PMID  24198334.
  21. ^ Орзалли, Меган Х .; Книп, Дэвид М. (2014). «Клеточное зондирование вирусной ДНК и механизмы уклонения от вирусов». Ежегодный обзор микробиологии. 68 (1): 477–492. Дои:10.1146 / annurev-micro-091313-103409. ISSN  0066-4227. ЧВК  4348004. PMID  25002095.
  22. ^ Орзалли, Меган Х .; Broekema, Nicole M .; Diner, Benjamin A .; Хэнкс, Дастин С .; Elde, Nels C .; Cristea, Ileana M .; Книп, Дэвид М. (2015). «cGAS-опосредованная стабилизация IFI16 способствует врожденной передаче сигналов во время инфицирования вирусом простого герпеса». Труды Национальной академии наук. 112 (14): E1773 – E1781. Дои:10.1073 / pnas.1424637112. ISSN  0027-8424. ЧВК  4394261. PMID  25831530.
  23. ^ Dudek, T. E .; Torres-Lopez, E .; Crumpacker, C .; Книп, Д. М. (2011). «Доказательства различий в иммунологических и патогенетических свойствах штаммов вируса простого герпеса 2 из США и Южной Африки». Журнал инфекционных болезней. 203 (10): 1434–1441. Дои:10.1093 / infdis / jir047. ISSN  0022-1899. ЧВК  3080912. PMID  21498376.
  24. ^ Книп, Дэвид М .; Кори, Лоуренс; Коэн, Джеффри I .; Дело, Кэролайн Д. (2014). Резюме и рекомендации семинара Национального института аллергии и инфекционных заболеваний (NIAID) по теме «Вакцины против вируса простого герпеса нового поколения»"". Вакцина. 32 (14): 1561–1562. Дои:10.1016 / j.vaccine.2014.01.052. ISSN  0264-410X. ЧВК  4786164. PMID  24480025.