FNBP1 - FNBP1

FNBP1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2EFL
Идентификаторы
Псевдонимы	FNBP1, FBP17, формин-связывающий белок 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 606191 MGI: 109606 ГомолоГен: 100983 Генные карты: FNBP1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 9 (человек)[1] Группа 9q34.11 Начните 129,887,187 бп[1] Конец 130,043,194 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 | 2 млрд Начните 31,026,206 бп[2] Конец 31,142,008 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • идентичное связывание с белками • липидное связывание Сотовый компонент • цитоплазма • клеточная мембрана • яма, покрытая клатрином • лизосома • клеточная кора • цитоскелет • мембрана • цитоплазматический пузырек • цитозоль Биологический процесс • эндоцитоз • мембранная организация Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	23048	14269
Ансамбль	ENSG00000187239	ENSMUSG00000075415
UniProt	Q96RU3	Q80TY0
RefSeq (мРНК)	NM_015033 NM_001363755	NM_001038700 NM_001177648 NM_001177649 NM_001177650 NM_019406 NM_001355105 NM_001355106
RefSeq (белок)	NP_055848 NP_001350684	NP_001033789 NP_001171119 NP_001171120 NP_001171121 NP_062279 NP_001342034 NP_001342035
Расположение (UCSC)	Chr 9: 129,89 - 130,04 Мб	Chr 2: 31.03 - 31.14 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Формин-связывающий белок 1 это белок что у людей кодируется FNBP1 ген.^[5][6][7]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства формин-связывающих белков. Белок содержит домен гомологии (FCH) с N-концевым Fer / Cdc42-взаимодействующим белком 4 (CIP4), за которым следует домен спиральной спирали, мотив, богатый пролином, второй домен спиральной спирали, домен, связывающий белок семейства Rho. (RBD) и C-концевой SH3 домен. Этот белок связывает сортирующий нексин 2 (SNX2), танкиразу (TNKS) и динамин; взаимодействие между этим белком и формином еще не было продемонстрировано у человека.^[7]

Взаимодействия

FNBP1 был показан взаимодействовать с участием:

• AKAP9,^[8]
• DNM1,^[9]
• Fas лиганд^[10]
• SNX2,^[6][11] и
• ТНКС.^[11]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000187239 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000075415 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Нагасе Т., Исикава К., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О. (август 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. IX. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». ДНК Res. 5 (1): 31–9. Дои:10.1093 / днарес / 5.1.31. PMID  9628581.
6. Fuchs U, Rehkamp G, Haas OA, Slany R, Kōnig M, Bojesen S, Bohle RM, Damm-Welk C, Ludwig WD, Harbott J, Borkhardt A (июль 2001 г.). «Человеческий формин-связывающий белок 17 (FBP17) взаимодействует с сортирующим нексином, SNX2, и является партнером слияния MLL при остром миелогенном лейкозе». Proc Natl Acad Sci U S A. 98 (15): 8756–61. Дои:10.1073 / pnas.121433898. ЧВК  37508. PMID  11438682.
7. «Ген Entrez: FNBP1 формин-связывающий белок 1».
8. Ларокка М.С., Шанкс Р.А., Тиан Л., Нельсон Д.Л., Стюарт Д.М., Голденринг-младший (июнь 2004 г.). «Взаимодействие AKAP350 с cdc42 взаимодействующим белком 4 в аппарате Гольджи». Мол. Биол. Ячейка. 15 (6): 2771–81. Дои:10.1091 / mbc.E03-10-0757. ЧВК  420101. PMID  15047863.
9. Камиока Ю., Фукухара С., Сава Х, Нагашима К., Масуда М., Мацуда М., Мотидзуки Н. (сентябрь 2004 г.). «Новая связывающая динамин молекула, формин-связывающий белок 17, вызывает инвагинации канальцевых мембран и участвует в эндоцитозе». J. Biol. Chem. 279 (38): 40091–9. Дои:10.1074 / jbc.M404899200. PMID  15252009.
10. Гадими М.П., ​​Санзенбахер Р., Тиде Б., Венцель Дж., Цзин К., Пломанн М., Боркхардт А., Кабелиц Д., Янссен О. (май 2002 г.). «Идентификация партнеров взаимодействия цитозольной полипролиновой области лиганда CD95 (CD178)». FEBS Lett. 519 (1–3): 50–8. Дои:10.1016 / s0014-5793 (02) 02709-6. PMID  12023017. S2CID  26765451.
11. Fuchs U, Rehkamp GF, Slany R, Follo M, Borkhardt A (ноябрь 2003 г.). «Формин-связывающий белок 17, FBP17, связывается через мотив связывания TNKS с танкиразой, белком, участвующим в поддержании теломер». FEBS Lett. 554 (1–2): 10–6. Дои:10.1016 / s0014-5793 (03) 01063-9. PMID  14596906. S2CID  19552309.

дальнейшее чтение

• Ричнау Н., Аспенстрём П. (2001). «Rich, белок, содержащий домен белка, активирующего rho GTPase, участвующий в передаче сигналов посредством Cdc42 и Rac1». J. Biol. Chem. 276 (37): 35060–70. Дои:10.1074 / jbc.M103540200. PMID  11431473.
• Гадими М.П., ​​Санзенбахер Р., Тиде Б., Венцель Дж., Цзин К., Пломанн М., Боркхардт А., Кабелиц Д., Янссен О. (2002). «Идентификация партнеров по взаимодействию цитозольной полипролиновой области лиганда CD95 (CD178)». FEBS Lett. 519 (1–3): 50–8. Дои:10.1016 / S0014-5793 (02) 02709-6. PMID  12023017. S2CID  26765451.
• Фудзита Х, Като Х, Исикава Й, Мори К., Негиси М. (2003). «Рапостлин - новый эффектор Rnd2 GTPase, вызывающий разветвление нейритов». J. Biol. Chem. 277 (47): 45428–34. Дои:10.1074 / jbc.M208090200. PMID  12244061.
• Като М, Като М (2004). «Ген FNBP2 на хромосоме 1q32.1 человека кодирует белок семейства ARHGAP с доменами FCH, FBH, RhoGAP и SH3». Int. J. Mol. Med. 11 (6): 791–7. Дои:10.3892 / ijmm.11.6.791. PMID  12736724.
• Fuchs U, Rehkamp GF, Slany R, Follo M, Borkhardt A (2003). «Формин-связывающий белок 17, FBP17, связывается через мотив связывания TNKS с танкиразой, белком, участвующим в поддержании теломер». FEBS Lett. 554 (1–2): 10–6. Дои:10.1016 / S0014-5793 (03) 01063-9. PMID  14596906. S2CID  19552309.
• Ларокка М.С., Шанкс Р.А., Тиан Л., Нельсон Д.Л., Стюарт Д.М., Голденринг-младший (2004). «Взаимодействие AKAP350 с взаимодействующим белком 4 cdc42 в аппарате Гольджи». Мол. Биол. Ячейка. 15 (6): 2771–81. Дои:10.1091 / mbc.E03-10-0757. ЧВК  420101. PMID  15047863.
• Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB, Mukherji M, Stettler-Gill M, Peters EC (2004). «Надежное фосфопротеомное профилирование сайтов фосфорилирования тирозина из Т-клеток человека с использованием аффинной хроматографии с иммобилизованным металлом и тандемной масс-спектрометрии». Анальный. Chem. 76 (10): 2763–72. Дои:10.1021 / ac035352d. PMID  15144186.
• Камиока Ю., Фукухара С., Сава Х, Нагашима К., Масуда М., Мацуда М., Мотидзуки Н. (2004). «Новая связывающая динамин молекула, формин-связывающий белок 17, вызывает инвагинации канальцевых мембран и участвует в эндоцитозе». J. Biol. Chem. 279 (38): 40091–9. Дои:10.1074 / jbc.M404899200. PMID  15252009.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М. А., Кантли Л. К., Гиги С. П. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Раш Дж, Мориц А., Ли К.А., Го А., Госс В.Л., Спек Э.Д., Чжан Х., Чжа Х.М., Полакевич Р.Д., Гребень М.Дж. (2005). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Nat. Биотехнология. 23 (1): 94–101. Дои:10.1038 / nbt1046. PMID  15592455. S2CID  7200157.
• Чжоу Ф.Л., Чжан В.Г., Чен Дж., Чжао WH, Цао Х.М., Чен YX, Тянь В., Лю Дж, Лю Ш. (2006). «Серологическая идентификация и биоинформатический анализ иммуногенных антигенов при множественной миеломе». Cancer Immunol. Immunother. 55 (8): 910–7. Дои:10.1007 / s00262-005-0074-х. PMID  16193335. S2CID  24083118.
• Цянь Дж., Чен В., Леттау М., Подда Г., Зёрниг М., Кабелиц Д., Янссен О. (2006). «Регулирование экспрессии FasL: семейство белков, содержащих домен SH3, участвующих в лизосомной ассоциации FasL». Cell. Сигнал. 18 (8): 1327–37. Дои:10.1016 / j.cellsig.2005.10.015. PMID  16318909.
• Ито Т., Эрдманн К.С., Ру А, Хаберманн Б., Вернер Х., Де Камилли П. (2006). «Динамин и актиновый цитоскелет совместно регулируют инвагинацию плазматической мембраны белками BAR и F-BAR». Dev. Ячейка. 9 (6): 791–804. Дои:10.1016 / j.devcel.2005.11.005. PMID  16326391.
• Цудзита К., Суэцугу С., Сасаки Н., Фурутани М., Оикава Т., Такенава Т. (2006). «Координация между актиновым цитоскелетом и деформацией мембраны новым доменом мембранных канальцев белков PCH участвует в эндоцитозе». J. Cell Biol. 172 (2): 269–79. Дои:10.1083 / jcb.200508091. ЧВК  2063556. PMID  16418535.