GSTM4 - GSTM4

GSTM4
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4GTU
Идентификаторы
Псевдонимы	GSTM4, GSTM4-4, GTM4, глутатион-S-трансфераза mu 4
Внешние идентификаторы	OMIM: 138333 MGI: 95862 ГомолоГен: 37357 Генные карты: GSTM4
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1п13.3 Начните 109,656,099 бп[1] Конец 109,674,836 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 | 3 F2.3 Начните 108,040,408 бп[2] Конец 108,044,894 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • трансферазная активность • связывание ферментов • активность глутатионтрансферазы • GO: 0001948 связывание с белками • активность гомодимеризации белков • связывание глутатиона Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • межклеточный мостик Биологический процесс • метаболизм • метаболический процесс глутатиона • процесс биосинтеза производных глутатиона • метаболический процесс нитробензола • ксенобиотический катаболический процесс • процесс биосинтеза длинноцепочечных жирных кислот Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	2948	14865
Ансамбль	ENSG00000168765	ENSMUSG00000027890
UniProt	Q03013	Q8R5I6
RefSeq (мРНК)	NM_000850 NM_147148 NM_147149	NM_001160411 NM_026764
RefSeq (белок)	NP_000841 NP_671489	NP_001153883 NP_081040
Расположение (UCSC)	Chr 1: 109.66 - 109.67 Мб	Chr 3: 108.04 - 108.04 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Глутатион S-трансфераза Mu 4 является фермент что у людей кодируется GSTM4 ген.^[5][6]

Цитозольные и связанные с мембраной формы глутатион-S-трансферазы кодируются двумя разными супергенными семействами. В настоящее время идентифицировано восемь различных классов растворимых цитоплазматических S-трансфераз глутатиона млекопитающих: альфа, каппа, мю, омега, пи, сигма, тета и дзета. Этот ген кодирует глутатион-S-трансферазу, принадлежащую к классу mu. Ферменты класса mu действуют при детоксикации электрофильных соединений, включая канцерогены, терапевтические препараты, токсины окружающей среды и продукты окислительного стресса, путем конъюгации с глутатионом. Гены, кодирующие мю-класс ферментов, организованы в кластер генов на хромосоме 1p13.3 и известны своей высокой полиморфностью. Эти генетические вариации могут изменить восприимчивость человека к канцерогенам и токсинам, а также повлиять на токсичность и эффективность некоторых лекарств. Диверсификация этих генов произошла в областях, кодирующих субстрат-связывающие домены, а также в паттернах тканевой экспрессии, чтобы приспособиться к возрастающему количеству чужеродных соединений. Идентифицировано несколько вариантов транскриптов, каждый из которых кодирует отдельную изоформу белка.^[6]

В августовском выпуске журнала Oncogen за 2009 г. исследователи из Института рака Хантсмана (HCI) Университета Юты продемонстрировали, что уровни экспрессии GSTM4 могут предсказать ответ на химиотерапию у пациентов с Саркома Юинга. Исследование показало, что пациенты, не ответившие на химиотерапию, имели высокий уровень GSTM4.^[7]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000168765 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027890 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Росс В.Л., Board PG, Webb GC (февраль 1994 г.). «Хромосомное картирование S-трансфераз глутатиона класса Mu человека на 1p13». Геномика. 18 (1): 87–91. Дои:10.1006 / geno.1993.1429. PMID  8276420.
6. «Ген Entrez: GSTM4 глутатион S-трансфераза M4».
7. OncoGenetics.Org (август 2009 г.). «Новая надежда на смертельный детский рак костей». OncoGenetics.Org. Архивировано из оригинал на 2015-09-24. Получено 2009-08-31.

дальнейшее чтение

• Богардс Дж. Дж., Ван Оммен Б., ван Бладерен П. Дж. (1992). «Очистка и характеристика восьми изоферментов глутатион S-трансферазы хомяка. Сравнение субъединичного состава ферментов печени, почек, семенников, поджелудочной железы и трахеи». Biochem. J. 286 (2): 383–8. Дои:10.1042 / bj2860383. ЧВК  1132909. PMID  1530570.
• Тейлор Дж. Б., Оливер Дж., Шеррингтон Р., Пембл С. Е. (1991). «Структура генов Mu класса глутатион S-трансферазы человека». Biochem. J. 274 (2): 587–93. Дои:10.1042 / bj2740587. ЧВК  1150179. PMID  2006920.
• Сайдегард Дж, Ворачек В.Р., Перо Р.В., Пирсон В.Р. (1988). «Наследственные различия в экспрессии человеческой глутатионтрансферазы, активной на оксиде транс-стильбена, обусловлены делецией гена». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 85 (19): 7293–7. Дои:10.1073 / пнас.85.19.7293. ЧВК  282172. PMID  3174634.
• Комсток К.Е., Видерстен М., Хао XY и др. (1994). «Сравнение ферментативных и физико-химических свойств человеческой глутатионтрансферазы M4-4 и трех других ферментов класса Mu человека». Arch. Biochem. Биофизы. 311 (2): 487–95. Дои:10.1006 / abbi.1994.1266. PMID  8203914.
• Розелл Б., Ханссон Х.А., Гутенберг С. и др. (1994). «Трансферазы глутатиона классов альфа, мю и пи проявляют селективную экспрессию в различных областях почек крысы». Ксенобиотика. 23 (8): 835–49. Дои:10.3109/00498259309059412. PMID  8284940.
• Комсток К.Е., Джонсон К.Дж., Рифенбери Д., Хеннер В.Д. (1993). «Выделение и анализ гена и кДНК человеческой глутатион-S-трансферазы класса Mu, GSTM4». J. Biol. Chem. 268 (23): 16958–65. PMID  8349586.
• Росс В.Л., Совет PG (1993). «Молекулярное клонирование и гетерологичная экспрессия альтернативно сплайсированного транскрипта глутатион-S-трансферазы класса Mu человека». Biochem. J. 294 (2): 373–80. Дои:10.1042 / bj2940373. ЧВК  1134464. PMID  8373352.
• Чжун С., Спурр Н.К., Хейс Дж. Д., Вольф С. Р. (1993). «Выведенная аминокислотная последовательность, структура гена и хромосомная локализация новой глутатион-S-трансферазы человека класса Mu, GSTM4». Biochem. J. 291 (1): 41–50. Дои:10.1042 / bj2910041. ЧВК  1132478. PMID  8471052.
• Пацковский Ю.В., Пацковская Л.Н., Листовский I (2000). «Замена аспарагин-фенилаланин объясняет каталитические различия между hGSTM3-3 и другими S-трансферазами мю-глутатиона человека». Биохимия. 38 (49): 16187–94. Дои:10.1021 / bi991714t. PMID  10587441.
• Beuckmann CT, Fujimori K, Urade Y, Hayaishi O (2000). «Идентификация трансфераз глутатиона мю-класса M2-2 и M3-3 в качестве цитозольных простагландин E-синтаз в мозге человека». Neurochem. Res. 25 (5): 733–8. Дои:10.1023 / А: 1007579507804. PMID  10905636.
• Лилоглу Т., Уолтерс М., Мэлони П. и др. (2003). «Полиморфизм T2517C в гене GSTM4 связан с риском развития рака легких». Рак легких. 37 (2): 143–6. Дои:10.1016 / S0169-5002 (02) 00078-8. PMID  12140136.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Stelzl U, Worm U, Lalowski M, et al. (2005). «Сеть взаимодействия белок-белок человека: ресурс для аннотирования протеома». Ячейка. 122 (6): 957–68. Дои:10.1016 / j.cell.2005.08.029. HDL:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID  16169070.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514.
• Денсон Дж., Си З., Ву И и др. (2006). «Скрининг межиндивидуальных различий в сплайсинге в человеческом GSTM4 и обнаружение одной нуклеотидной замены, связанной с тандемным пропуском двух экзонов». Ген. 379: 148–55. Дои:10.1016 / j.gene.2006.05.012. PMID  16854533.

внешние ссылки

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: Q03013 (Глутатион S-трансфераза Mu 4) в PDBe-KB.