MassTag-PCR - MassTag-PCR - Wikipedia

MassTag PCR это модификация ПЦР на основе масс-спектрометрический обнаружение конечного продукта. Эта технология была впервые предложена ученым из Центра инфекций и иммунитета (CII) Школы общественного здравоохранения им. Колумбийский университет, СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ.[нужна цитата ]

Принципы

Как и в обычной ПЦР, MassTag-PCR использует пары праймеров. Разница в том, что праймеры, используемые для MassTag PCR, помечены молекулами известной массы или MassCodes. Вместо одной пары праймеров в этой технологии используется несколько праймеров, что делает ее мультиплексной системой. В отличие от традиционной системы мультиплексной ПЦР, в MassTag PCR можно использовать более 15 пар праймеров. Если ДНК от любого агента праймерной панели присутствует, он будет амплифицирован. Каждый амплифицированный продукт будет иметь свои специфические коды масс. Затем продукт ПЦР очищается для удаления несвязанных праймеров, dNTP, фермента и других примесей. Наконец, очищенные продукты ПЦР подвергают УФ легкий, поскольку химическая связь между нуклеиновыми кислотами и праймерами фотолабильный. Поскольку масс-коды выделяются из продуктов ПЦР, они обнаруживаются с помощью масс-спектрометра. Наличие определенного MassCode указывает на присутствие определенного патогена.[1]

Приложения

Было обнаружено, что этот метод обнаруживает ранее не охарактеризованную кладу риновирус.[2] MassTag PCR - более комплексный и чувствительный метод диагностики, CII смогла определить причину этого заболевания в 26 из 79 ранее неизвестных случаев. MassTag PCR продемонстрировала свою трехстороннюю ценность как инструмент для наблюдения, обнаружения вспышек и эпидемиология.

Рекомендации

  1. ^ Бризе, Т; и другие. (Февраль 2005 г.). «Диагностическая система для быстрого и чувствительного дифференциального обнаружения патогенов». Emerg Infect Dis. 11 (2): 310–3. Дои:10.3201 / eid1102.040492. ЧВК  3320438. PMID  15752453.
  2. ^ Домингес, Сэмюэл Р .; и другие. (Октябрь 2008 г.). «Мультиплексная MassTag-ПЦР на респираторные патогены в педиатрических смывах носоглотки, отрицательная при обычном диагностическом тестировании, показывает высокую распространенность вирусов, принадлежащих к недавно признанной кладе риновирусов». Журнал клинической вирусологии. 43 (2): 219–222. Дои:10.1016 / j.jcv.2008.06.007. ЧВК  2603178. PMID  18674964.