NAALADL2 - NAALADL2

Нааладль2
Идентификаторы
Псевдонимы2810043G22RikEG635702Gm1021N-ацетилированная альфа-связанная кислая дипептидаза-подобная 2NAALADL2
Внешние идентификаторыГомолоГен: 45786 Генные карты: [1]
Расположение гена (человек)
Хромосома 3 (человек)
Chr.Хромосома 3 (человек)
Хромосома 3 (человек)
Геномное расположение Naaladl2
Геномное расположение Naaladl2
Группа3 | 3 A3Начинать23,798,102 бп
Конец25,144,261 бп
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

635702

н / д

Ансамбль

ENSMUSG00000102758

н / д

UniProt

A0A0N4SUJ3

н / д

RefSeq (мРНК)

NM_001326288

н / д

RefSeq (белок)

NP_001313217

н / д

Расположение (UCSC)Chr 3: 23,8 - 25,14 Мбн / д
PubMed поиск[1]н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

N-ацетилированная альфа-связанная кислая дипептидаза, подобная 2 (NAALADL2) - это белок, кодируемый геном NAALADL2 в людях. NAALADL2 имеет 25–26% идентичность последовательностей и 45% сходства последовательностей с семейством глутаматкарбоксипептидазы II, которое включает маркер рака простаты PSMA (FOLH1/NAALAD1).[2] Ген NAALADL2 - это гигантский ген размером 1,37 т.п.н., что примерно в 49 раз больше, чем средний размер гена в 28 т.п.н.[2][3] Длина гена коррелирует с количеством вариантов транскрипта гена как такового, NAALADL2 проходит обширную альтернативную сварку и имеет 12 вариантов сварки согласно определению Ensembl.[4][5]

Функция

Текущая функция NAALADL2 неизвестна. NAALADL2 проявляет значительную гомологию с N-ацетилированной альфа-связанной кислой дипептидазой и рецепторы трансферрина. Имея некоторую гомологию с семейством металлопептидаз M28B, NAALADL2 не содержит предпочтительных аминокислот в определенных ключевых положениях, которые являются высококонсервативными и важными для функции металлопептидазы, что может означать, что она каталитически неактивна.[2]

Клиническое значение

NAALADL2 было показано, что он разорван Корнелия Де Ланж -ассоциированный перемещение точка останова в 3q26.3.[2]

Модель rs17531088 SNP в NAALADL2 была показана связь с болезнью Кавасаки в большом GWAS состоящий из двух независимых когорт с общим числом пациентов 893 КД плюс популяционный и семейный контроль.[6]

NAALADL2 при раке

Было показано, что NAALADL2 играет роль в развитии рака простаты.[7] Экспрессия белка NAALADL2 связана со стадией опухоли простаты и оценка с экспрессией мРНК, предсказывающей плохую выживаемость после радикальной простатэктомии в небольшой когорте.[7] Сверхэкспрессия NAALADL2 в Сотовые линии впоследствии измененное связывание с компонентами внеклеточного матрикса (ЕСМ) и усиление инвазивной способности рака простаты клетки.[7] Когда экспрессия NAALADL2 была искусственно увеличена в клеточных линиях, гены, участвующие в клеточный цикл, клеточная адгезия, эпителиально-мезенхимальный переход и цитоскелет ремоделирование было изменено.[7] Эти результаты предполагают, что NAALADL2 может управлять агрессивным раком простаты.

А полногеномное исследование ассоциации (GWAS) из 12 518 случаев рака простаты обнаружен SNP; rs78943174, в пределах 3q26.31 (NAALADL2) локус, связанный с высоким Сумма баллов по Глисону.[8] Второе исследование SNP, встречающихся в общих сайтах связывания транскрипционных факторов, идентифицировало SNP; rs10936845 в мотиве GATA2.[9] Этот SNP увеличивал экспрессию NAALADL2 экспрессия у пациентов с раком простаты, с повышенной экспрессией, также предсказывающей биохимический рецидив.[9]

При раке простаты соматический количество копий в NAALADL2 присутствуют примерно у 16% пациентов с локализованным заболеванием, увеличиваясь до 30% Оценка Глисона 5 болезней и 50% Т этап 4 болезнь.[10] сопутствует соседнему онкогену TBL1XR1.[10] Частота CNA прибыль в NAALADL2 ассоциируются с рядом клинических признаков агрессивного рака простаты, включая степень Глисона, стадию опухоли, положительный результат хирургические поля и рак, который распространился на лимфатический узел.[10] Частота увеличения числа копий в этой генетической области также увеличивается в кастрат стойкий и нейроэндокринный рак простаты.[10]

В окрестностях NAALADL2 богат онкогенами.[11] Увеличение числа копий в NAALADL2 часто встречаются вместе с соседними онкогенами, включая: BCL6, ATR и члены семейства PI3K.[10] Увеличение числа копий на уровне ДНК связано с изменениями экспрессии мРНК в более чем 450 известных онкогенах, что позволяет предположить, что эта область может играть важную роль в развитии агрессивного рака простаты.[10]

Исследование метастатического рака простаты, устойчивого к кастрату (mCRPC), обнаружило антисмысловую цепь NAALADL2 (NAALADL2-AS2) более чем в 2 раза выше у пациентов с мКРРПЖ по сравнению со здоровыми добровольцами.[12] Пациенты с высшим NAALADL2-AS2 экспрессия имела улучшенный ответ на энзалутамид по сравнению с таковыми с более низкой экспрессией.[12]

В рак молочной железы, сфероиды многоклеточных опухолей (MTS) являются 3D клеточные культуры которые приобретают дифференцированные межклеточные соединения и определенное микроокружение, по-разному экспрессируя ряд молекул адгезии, таких как EPCAM, E-кадгерин, интегрины и синдеканы по сравнению с 2D монокультуры.[13] Было показано, что NAALADL2 по-разному экспрессируется в MTS по сравнению с 2D-культурами.[13] Эти результаты подтверждают роль NAALADL2 в межклеточных взаимодействиях и согласуются с данными о раке простаты, которые обнаруживают, что NAALADL2 влияет на клетки.ECM взаимодействия.[13][7]

SNP в NAALADL2 также были идентифицированы в GWAS риска рака для рака груди и рака легких.[14][15]

Рекомендации

  1. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  2. ^ а б c d Тонкин Е.Т., Смит М., Эйхорн П., Джонс С., Имамверди Б., Линдси С. и др. (Июль 2004 г.). «Гигантский новый ген, подвергающийся обширному альтернативному сплайсингу, разрывается точкой разрыва транслокации, связанной с Корнелией де Ланге, в 3q26.3». Генетика человека. 115 (2): 139–48. Дои:10.1007 / s00439-004-1134-6. ЧВК  4894837. PMID  15168106.
  3. ^ Вентер Дж. К., Адамс, доктор медицины, Майерс Э. У., Ли П. У., Фреска Р. Дж., Саттон Г. Г. и др. (Февраль 2001 г.). «Последовательность генома человека». Наука. 291 (5507): 1304–51. Bibcode:2001Научный ... 291.1304V. Дои:10.1126 / science.1058040. PMID  11181995. S2CID  85981305.
  4. ^ Гришкевич В., Янай И. (сентябрь 2014 г.). «Длина гена и уровень экспрессии формируют геномные новинки». Геномные исследования. 24 (9): 1497–503. Дои:10.1101 / гр.169722.113. ЧВК  4158763. PMID  25015383.
  5. ^ Каннингем Ф., Ачутан П., Аканни В., Аллен Дж., Амод М. Р., Армеан И. М. и др. (Январь 2019). «Ансамбль 2019». Исследования нуклеиновых кислот. 47 (D1): D745 – D751. Дои:10.1093 / нар / gky1113. ЧВК  6323964. PMID  30407521.
  6. ^ Бургнер Д., Давила С., Бреунис В. Б., Нг С. Б., Ли Ю., Боннар С. и др. (Январь 2009 г.). «Полногеномное исследование ассоциации определяет новые и функционально связанные локусы восприимчивости к болезни Кавасаки». PLOS Genetics. 5 (1): e1000319. Дои:10.1371 / journal.pgen.1000319. ЧВК  2607021. PMID  19132087.
  7. ^ а б c d е Whitaker HC, Shiong LL, Kay JD, Grönberg H, Warren AY, Seipel A, et al. (Ноябрь 2014 г.). «N-ацетил-L-аспартил-L-глутаматпептидаза, подобная 2, сверхэкспрессируется при раке и способствует промиграционному и прометастатическому фенотипу». Онкоген. 33 (45): 5274–87. Дои:10.1038 / onc.2013.464. PMID  24240687. S2CID  40840044.
  8. ^ Берндт С.И., Ван З., Йегер М., Алаванджа М.К., Албейнс Д., Амундадоттир Л. и др. (Май 2015 г.). «Два локуса чувствительности, идентифицированные для агрессивности рака простаты». Nature Communications. 6: 6889. Bibcode:2015НатКо ... 6.6889.. Дои:10.1038 / ncomms7889. ЧВК  4422072. PMID  25939597.
  9. ^ а б Джин Х. Дж., Юнг С., Деброй А. Р., Давулури Р. В. (август 2016 г.). «Идентификация и проверка регуляторных SNP, которые модулируют связывание фактора транскрипции с хроматином и экспрессию генов при раке простаты». Oncotarget. 7 (34): 54616–54626. Дои:10.18632 / oncotarget.10520. ЧВК  5338917. PMID  27409348.
  10. ^ а б c d е ж Симпсон, Бенджамин С .; Камачо, Недзица; Лакстон, Хейли Дж .; Пай, Хейли; Финн, Рон; Хиви, Сьюзен; Питт, Джейсон; Мур, Кэролайн М .; Уитакер, Хейли К. (14 августа 2020 г.). «Генетические изменения в локусе 3q26.31-32 придают агрессивный фенотип рака простаты». Биология коммуникации. 3 (1): 440. Дои:10.1038 / с42003-020-01175-х. ISSN  2399-3642. ЧВК  7429505. PMID  32796921. S2CID  221118233.
  11. ^ Fields AP, Justilien V, Murray NR (январь 2016 г.). «Хромосома 3q26 OncCassette: мультигенный фактор рака человека». Достижения в биологической регуляции. 60: 47–63. Дои:10.1016 / j.jbior.2015.10.009. ЧВК  4729592. PMID  26754874.
  12. ^ а б Бенойст Г.Е., ван Оорт И.М., Бурригтер Э., Верхаг Г.В., ван Хойдж О., Гроен Л. и др. (Июнь 2020 г.). «Прогностическая ценность новых жидких биомаркеров у пациентов с метастатическим устойчивым к кастрации раком простаты, получавших энзалутамид: проспективное обсервационное исследование». Клиническая химия. 66 (6): 842–851. Дои:10.1093 / Clinchem / hvaa095. PMID  32408351. S2CID  218650088.
  13. ^ а б c Пачеко-Марин Р., Мелендес-Зайгла Дж., Кастильо-Рохас Дж., Мандухано-Тиноко Е., Гарсия-Вензор А., Урибе-Карвахал С. и др. (Март 2016 г.). «Транскриптомный профиль ранних стадий опухолевых сфероидов рака груди». Научные отчеты. 6: 23373. Bibcode:2016НатСР ... 623373П. Дои:10.1038 / srep23373. ЧВК  4810430. PMID  27021602.
  14. ^ Мурабито Дж. М., Розенберг С. Л., Фингер Д., Крегер Б. Е., Леви Д., Сплански Г. Л. и др. (Сентябрь 2007 г.). «Полногеномное ассоциативное исследование рака груди и простаты в рамках исследования сердца во Фрамингеме, проведенное NHLBI». BMC Medical Genetics. 8 Приложение 1: S6. Дои:10.1186 / 1471-2350-8-S1-S6. ЧВК  1995609. PMID  17903305.
  15. ^ Lan Q, Hsiung CA, Matsuo K, Hong YC, Seow A, Wang Z и др. (Декабрь 2012 г.). «Полногеномный ассоциативный анализ выявил новые локусы восприимчивости к раку легких у никогда не курящих женщин в Азии». Природа Генетика. 44 (12): 1330–5. Дои:10.1038 / ng.2456. ЧВК  4169232. PMID  23143601.