NIF3L1 - NIF3L1

NIF3L1
Идентификаторы
Псевдонимы	NIF3L1, ALS2CR1, CALS-7, MDS015, NGG1 взаимодействующий фактор 3, как 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 605778 MGI: 1929485 ГомолоГен: 5881 Генные карты: NIF3L1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2q33.1 Начинать 200,889,327 бп[1] Конец 200,903,938 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 | 1 C1.3 Начинать 58,445,151 бп[2] Конец 58,481,816 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание фактора транскрипции • GO: 0001948 связывание с белками • идентичное связывание с белками Сотовый компонент • цитоплазма • ядро клетки • митохондрия Биологический процесс • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция транскрипции с использованием шаблона нуклеиновой кислоты • дифференциация нейронов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	60491	65102
Ансамбль	ENSG00000196290	ENSMUSG00000026036
UniProt	Q9GZT8	Q9EQ80
RefSeq (мРНК)	NM_001136039 NM_001142355 NM_001142356 NM_021824 NM_001369441 NM_001369442 NM_001369443 NM_001369444 NM_001369445	NM_022988
RefSeq (белок)	NP_001129511 NP_001135827 NP_001135828 NP_068596 NP_001356370 NP_001356371 NP_001356372 NP_001356373 NP_001356374	NP_075364
Расположение (UCSC)	Chr 2: 200,89 - 200,9 Мб	Chr 1: 58.45 - 58.48 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

NIF3-подобный белок 1 это белок что у людей кодируется NIF3L1 ген.^[5][6][7][8]

Взаимодействия

NIF3L1 был показан взаимодействовать с COPS2.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000196290 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026036 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Tascou S, Uedelhoven J, Dixkens C, Nayernia K, Engel W., Burfeind P (январь 2001 г.). «Выделение и характеристика нового человеческого гена, NIF3L1, и его мышиного ортолога, Nif3l1, высоко консервативных от бактерий к млекопитающим». Цитогенетика и клеточная генетика. 90 (3–4): 330–6. Дои:10.1159/000056799. PMID  11124544. S2CID  23200951.
6. Хадано С., Янагисава И., Скауг Дж., Фихтер К., Насир Дж., Мартиндейл Д., Куп Б.Ф., Шерер С.В., Николсон Д.В., Руло Г.А., Икеда Дж., Хайден М.Р. (январь 2001 г.). «Клонирование и характеристика трех новых генов, ALS2CR1, ALS2CR2 и ALS2CR3, в критической области ювенильного бокового амиотрофического склероза (ALS2) на хромосоме 2q33-q34: гены-кандидаты для ALS2». Геномика. 71 (2): 200–13. Дои:10.1006 / geno.2000.6392. PMID  11161814.
7. Акияма Х., Фудзисава Н., Таширо Ю., Таканабэ Н., Сугияма А., Таширо Ф. (март 2003 г.). «Роль транскрипционного корепрессора Nif3l1 на ранней стадии нейральной дифференцировки через сотрудничество с Trip15 / CSN2». Журнал биологической химии. 278 (12): 10752–62. Дои:10.1074 / jbc.M209856200. PMID  12522100.
8. «Ген Entrez: NIF3L1 NIF3 NGG1, взаимодействующий фактор 3-подобный 1 (S. pombe)».

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Конструирование и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК с обогащением по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Tascou S, Kang TW, Trappe R, Engel W., Burfeind P (сентябрь 2003 г.). «Идентификация и характеристика NIF3L1 BP1, нового цитоплазматического партнера по взаимодействию белка NIF3L1». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 309 (2): 440–8. Дои:10.1016 / j.bbrc.2003.07.008. PMID  12951069.
• Мерла Дж., Ховальд С., Антонаракис С. Е., Реймонд А. (июль 2004 г.). «Субклеточная локализация ChoRE-связывающего белка, кодируемого геном 14 критической области синдрома Вильямса-Бёрена, регулируется 14-3-3». Молекулярная генетика человека. 13 (14): 1505–14. Дои:10,1093 / hmg / ddh163. PMID  15163635.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Дж., Ли С., Альбала Дж. С., Лим Дж., Фраутон С., Лламосас Э, Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р. С., Ванденхаут Дж., Зогби HY, Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусет-Штамм Л., Кусик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видаль М. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Лим Дж., Хао Т., Шоу С., Патель А.Дж., Сабо Дж., Руал Дж. Ф., Фиск С.Дж., Ли Н., Смоляр А., Хилл Д.Е., Барабаши А.Л., Видал М., Зогби Х.Й. (май 2006 г.). «Сеть межбелкового взаимодействия для унаследованных атаксий человека и нарушений дегенерации клеток Пуркинье». Клетка. 125 (4): 801–14. Дои:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID  16713569. S2CID  13709685.