NLRP4 - NLRP4

NLRP4
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4EWI
Идентификаторы
Псевдонимы	NLRP4, CLR19.5, CT58, NALP4, PAN2, PYPAF4, RNH2, семейство NLR, пириновый домен, содержащий 4, пириновый домен семейства NLR, содержащий 4
Внешние идентификаторы	OMIM: 609645 MGI: 1890518 ГомолоГен: 75315 Генные карты: NLRP4
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19q13.43 Начинать 55,836,540 бп[1] Конец 55,881,855 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 | 7 A1 Начинать 6,045,161 бп[2] Конец 6,105,150 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание нуклеотидов • Связывание АТФ Сотовый компонент • цитозоль Биологический процесс • воспалительная реакция • регулирование выработки интерферона I типа Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	147945	83564
Ансамбль	ENSG00000160505	ENSMUSG00000034690
UniProt	Q96MN2	Q3TKR3
RefSeq (мРНК)	NM_134444	NM_031389
RefSeq (белок)	NP_604393	NP_113566
Расположение (UCSC)	Chr 19: 55,84 - 55,88 Мб	Chr 7: 6.05 - 6.11 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок 4, содержащий домены NACHT, LRR и PYD это белок что у людей кодируется NLRP4 ген.^[5][6][7]

НАЛП цитоплазматический белки, которые образуют подсемейство в более крупном семействе белков CATERPILLER. Большинство коротких NALP, таких как NALP4, имеют N-концевой пириновый (MEFV; MIM 608107) домен (PYD), за которым следует домен NACHT, домен, связанный с NACHT (NAD), и C-терминал область богатых лейцином повторов (LRR).

Длинный NALP, NALP1 (MIM 606636), также имеет C-концевое расширение, содержащее функцию поиска домена (FIIND) и домен найма caspase (КАРТА). NALP участвуют в активации провоспалительный каспасы (например, CASP1; MIM 147678) через их участие в мультибелковых комплексах, называемых инфламмасомы (Tschopp et al., 2003) [предоставлено OMIM]^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000160505 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034690 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Tschopp J, Martinon F, Burns K (февраль 2003 г.). «NALP: новое семейство белков, участвующих в воспалении». Нат Рев Мол Cell Biol. 4 (2): 95–104. Дои:10.1038 / nrm1019. PMID  12563287. S2CID  31417018.
6. Ван Л., Манджи Г. А., Гренье Дж. М., Аль-Гарави А., Мерриам С., Лора Дж. М., Геддес Б. Дж., Брискин М., ДиСтефано П.С., Бертин Дж. (Август 2002 г.). «PYPAF7, новый PYRIN-содержащий Apaf1-подобный белок, который регулирует активацию NF-каппа B и процессинг цитокинов, зависимый от каспазы-1». J Biol Chem. 277 (33): 29874–80. Дои:10.1074 / jbc.M203915200. PMID  12019269.
7. «Ген Entrez: семейство NLRP4 NLR, пириновый домен, содержащий 4».

дальнейшее чтение

• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Дамиано Дж. С., Оливейра В., Валлийский К., Рид Дж. К. (2004). «Гетеротипические взаимодействия между доменами NACHT: значение для регуляции врожденных иммунных ответов». Biochem. J. 381 (Пт 1): 213–9. Дои:10.1042 / BJ20031506. ЧВК  1133779. PMID  15107016.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Гренье Дж. М., Ван Л., Манджи Г. А. и др. (2002). «Функциональный скрининг пяти членов семейства PYPAF идентифицирует PYPAF5 как новый регулятор NF-kappaB и каспазы-1». FEBS Lett. 530 (1–3): 73–8. Дои:10.1016 / S0014-5793 (02) 03416-6. PMID  12387869. S2CID  25023390.
• Fiorentino L, Stehlik C, Oliveira V и др. (2002). «Новый PAAD-содержащий белок, который модулирует индукцию NF-каппа B цитокинами, фактором некроза опухоли альфа и интерлейкином-1бета». J. Biol. Chem. 277 (38): 35333–40. Дои:10.1074 / jbc.M200446200. PMID  12093792.