Нуклеопорин 62 - Nucleoporin 62 - Wikipedia

NUP62
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 5IJN, 5IJO
Идентификаторы
Псевдонимы	NUP62, IBSN, SNDI, p62, нуклеопорин 62 кДа, нуклеопорин 62
Внешние идентификаторы	OMIM: 605815 MGI: 1351500 ГомолоГен: 68773 Генные карты: NUP62
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19q13.33 Начинать 49,906,825 бп[1] Конец 49,929,763 бп[1]
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание с белком Hsp90 • Привязка домена SH2 • связывание хроматина • связывание рецептора тироидного гормона • Привязка домена PTB • Связывание с белком Hsp70 • GO: 0001948 связывание с белками • связывание убиквитина • активность каркаса сигнального комплекса рецепторов • GO: 0005487 структурная составляющая ядерной поры • связывание фосфолипидов • связывание кинезина Сотовый компонент • не мембрана • Тело Флемминга • ядерная пора • кольцевидные ламели • цитоскелет • центральный транспортный канал ядерной поры • полюс шпинделя • цитоплазма • центросома • митотическое веретено • ядерная оболочка • центр организации микротрубочек • ядро клетки • макромолекулярный комплекс • рибонуклеопротеин • клетка-хозяин Биологический процесс • транспорт мРНК • отрицательная регуляция сигнального пути рецептора эпидермального фактора роста • регуляция передачи сигнала белка Ras • смерть клетки • отрицательная регуляция апоптотического процесса • транскрипция, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция передачи сигнала белка Ras • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • клеточное старение • сигнальный путь рецептора клеточной поверхности • регулирование передачи сигнала • отрицательная регуляция активности MAP-киназы • сперматогенез • регулирование импорта белка в ядро • гормонально-опосредованный сигнальный путь • положительная регуляция передачи сигналов I-kappaB киназы / NF-kappaB • транспорт белка • отрицательная регуляция запрограммированной гибели клеток • ядерный транспорт • GO: 0022415 вирусный процесс • положительная регуляция сигнального пути рецептора эпидермального фактора роста • отрицательное регулирование пролиферации клеток • экспорт рибонуклеопротеинового комплекса из ядра • импорт белка в ядро • экспорт мРНК из ядра • конгресс митотической метафазной пластинки • разделение митотических центросом • положительная регуляция митотического деления ядра • положительная регуляция репликации центриолей • регуляция организации митотического веретена • центриоль в сборе • положительная регуляция митотического цитокинетического процесса • положительная регуляция локализации белка на центросоме • центросомный цикл • GO: 0007067 митотический клеточный цикл • гетеротримеризация белков • регулирование гликолитического процесса • экспорт тРНК из ядра • белковое сумоилирование • вирусная транскрипция • регуляция сайленсинга генов с помощью miRNA • GO: 0046795 внутриклеточный транспорт вируса • регуляция клеточного ответа на тепло Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	23636	18226
Ансамбль	ENSG00000213024	ENSMUSG00000109511
UniProt	P37198	Q63850
RefSeq (мРНК)	NM_153719 NM_001193357 NM_012346 NM_016553 NM_153718	NM_053074
RefSeq (белок)	NP_001180286 NP_036478 NP_057637 NP_714940 NP_714941	NP_444304
Расположение (UCSC)	Chr 19: 49.91 - 49.93 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Нуклеопорин p62 (p62) представляет собой белковый комплекс, связанный с ядерная оболочка. Белок p62 остается связанным с ядерный поровый комплекс -ламина фракция. p62 синтезируется как растворимый цитоплазматический предшественник 61 кДа^[4] с последующей модификацией, включающей добавление остатков N-ацетилглюкозамина,^[5] с последующей ассоциацией с другими сложными белками.

Комплекс ядерных пор представляет собой массивную структуру, которая простирается через ядерную оболочку, образуя ворота, которые регулируют поток макромолекул между ядром и цитоплазмой. Нуклеопорины являются основными компонентами комплекса ядерных пор в эукариотических клетках. Белок, кодируемый этим геном, является членом нуклеопоринов, содержащих FG-повтор, и локализован в центральной пробке ядерной поры. Этот белок связывается с комплексом importin альфа / бета, который участвует в импорте белков, содержащих сигналы ядерной локализации. Множественные варианты транскриптов этого гена кодируют одну изоформу белка.^[6]

Структура

P62 представляет собой богатый серином / треонином белок, состоящий из ~ 520 аминокислот, с тетрапептидными повторами на аминоконце и серией альфа-спиральных участков с гидрофобными гептада повторяет^[7] формирование бета-винт домен. P62 собирается в комплекс, содержащий 3 дополнительных белка, p60, p54 и p45. ^[8][9] формирование p62 комплекс ~ 235 кДа. О-GlcNAцилирование по-видимому, участвует в сборке и разборке p62 в комплексы более высокого порядка, а богатая серином / треонином линкерная область между Ser270 и Thr294, по-видимому, является регуляторной.^[10] В p62 комплекс локализован как на нуклеоплазматической, так и на цитоплазматической сторонах порового комплекса, и относительный диаметр комплекса p62 по отношению к ядерному комплексу поры предполагает, что он взаимодействует при открытии пор.^[11]

Функция

P62, по-видимому, взаимодействует с мРНК во время транспорта из ядра.^[12] P62 также взаимодействует с белком фактора ядерного транспорта (NTF2), который участвует в транспортировке белков между цитоплазмой и ядром.^[13] Другой белок, importin (бета), связывается с участком спирального стержня p62, который также связывает NTF2, что свидетельствует о формировании стробирующего комплекса более высокого порядка.^[14] Кариоферин бета2 (транспортин), переносчик рибопротеинов, также взаимодействует с p62.^[15] P62 также взаимодействует с Nup93,^[16] и когда Nup98 истощен, p62 не может собраться с комплексами ядерных пор.^[17] Мутантные поры не могут стыковаться / транспортировать белки с сигналами ядерной локализации или сигналами импорта M9.

Патология

Антитела к p62 комплекс вовлечены в одно или несколько аутоиммунных заболеваний. Гликозилирование P62 повышено при диабете^[18] и может влиять на его связь с другими заболеваниями. p62 также чаще встречается на стадии IV. первичный билиарный цирроз и является прогностическим признаком тяжелого заболевания.^[19]

Взаимодействия

Было показано, что нуклеопорин 62 взаимодействовать с:

• HSF2,^[20]
• КПНБ1,^[14][21]
• NUTF2,^[22][23]
• TRAF3,^[24] и
• XPO1,^[25][26]
• Nup93.^[16]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000213024 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Дэвис Л.И., Блобель Г. (1986). «Идентификация и характеристика сложных белков ядерных пор». Клетка. 45 (5): 699–709. Дои:10.1016/0092-8674(86)90784-1. PMID  3518946. S2CID  22170880.
5. Дэвис Л.И., Блобель Г. (1987). «Комплекс ядерных пор содержит семейство гликопротеинов, которое включает р62: гликозилирование посредством ранее не идентифицированного клеточного пути». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 84 (21): 7552–6. Bibcode:1987PNAS ... 84.7552D. Дои:10.1073 / pnas.84.21.7552. ЧВК  299337. PMID  3313397.
6. «Ген Entrez: нуклеопорин NUP62 62 кДа».
7. Старр CM, Д'Онофрио М, Парк МК, Ганновер, Дж. А (1990). «Первичная последовательность и гетерологичная экспрессия гликопротеина р62 ядерных пор». J. Cell Biol. 110 (6): 1861–71. Дои:10.1083 / jcb.110.6.1861. ЧВК  2116139. PMID  2190987.
8. Кита К., Омата С., Хоригоме Т. (1993). «Очистка и характеристика гликопротеинового комплекса ядерной поры, содержащего p62». J. Biochem. 113 (3): 377–82. Дои:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a124054. PMID  8486610.
9. Басс Ф, Стюарт М (1995). «Макромолекулярные взаимодействия в комплексе нуклеопорина p62 ядерных пор крысы: связывание нуклеопорина p54 с стержневым доменом p62». J. Cell Biol. 128 (3): 251–61. Дои:10.1083 / jcb.128.3.251. ЧВК  2120351. PMID  7531196.
10. Любас В.А., Смит М., Старр К.М., Ганновер Дж. А. (1995). «Анализ гликозилирования белка р62 ядерных пор». Биохимия. 34 (5): 1686–94. Дои:10.1021 / bi00005a025. PMID  7849028.
11. Гуан Т., Мюллер С., Клир Дж., Панте Н., Блевитт Дж. М., Ханер М., Паскаль Б., Эби Ю., Джерас Л. (1995). «Структурный анализ комплекса p62, сборки O-связанных гликопротеинов, который располагается вблизи центрального закрытого канала комплекса ядерных пор». Мол. Биол. Клетка. 6 (11): 1591–603. Дои:10.1091 / mbc.6.11.1591. ЧВК  301313. PMID  8589458.
12. Dargemont C, Schmidt-Zachmann MS, Kühn LC (1995). «Прямое взаимодействие нуклеопорина p62 с мРНК во время его экспорта из ядра». J. Cell Sci. 108 (1): 257–63. PMID  7738103.
13. Баллок Т.Л., Кларксон В.Д., Кент Х.М., Стюарт М. (1996). «Кристаллическая структура с разрешением 1,6 ангстрем ядерного транспортного фактора 2 (NTF2)». J. Mol. Биол. 260 (3): 422–31. Дои:10.1006 / jmbi.1996.0411. PMID  8757804.
14. Percipalle P, Кларксон WD, Кент HM, Rhodes D, Stewart M (1997). «Молекулярные взаимодействия между гетеродимером импортина альфа / бета и белками, участвующими в импорте ядерного белка позвоночных». J. Mol. Биол. 266 (4): 722–32. Дои:10.1006 / jmbi.1996.0801. PMID  9102465.
15. Ясин Н.Р., Блобель Г. (1997). «Клонирование и характеристика кариоферина β3 человека». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 94 (9): 4451–6. Bibcode:1997PNAS ... 94.4451Y. Дои:10.1073 / пнас.94.9.4451. ЧВК  20743. PMID  9114010.
16. Гранди П., Данг Т., Пане Н., Шевченко А., Манн М., Форбс Д., Хёрт Э (1997). «Nup93, позвоночный гомолог дрожжевого Nic96p, образует комплекс с новым 205-кДа белком и необходим для правильной сборки ядерных пор». Мол. Биол. Клетка. 8 (10): 2017–38. Дои:10.1091 / mbc.8.10.2017. ЧВК  25664. PMID  9348540.
17. Ву Х, Каспер Л.Х., Манчева Р.Т., Манчев Г.Т., Спрингетт М.Дж., ван Дерсен Дж.М. (2001). «Нарушение FG нуклеопорина NUP98 вызывает избирательные изменения в стехиометрии и функции комплекса ядерных пор». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 98 (6): 3191–6. Bibcode:2001PNAS ... 98,3191 Вт. Дои:10.1073 / pnas.051631598. ЧВК  30629. PMID  11248054.
18. Хан I, О ES, Kudlow JE (2000). «Чувствительность состояния O-связанной модификации N-ацетилглюкозамина белка ядерной поры p62 на внеклеточную концентрацию глюкозы». Biochem. J. 350 Pt 1 (Pt 1): 109–14. Дои:10.1042/0264-6021:3500109. ЧВК  1221231. PMID  10926833.
19. Миячи К., Хэнкинс Р.В., Мацусима Х., Кикучи Ф., Иномата Т., Хоригоме Т., Сибата М., Онодзука Й., Уэно Ю., Хашимото Е., Хаяси Н., Сибуя А., Амаки С., Миякава Х (2003). «Профиль и клиническое значение антител против ядерной оболочки, обнаруженных у пациентов с первичным билиарным циррозом: многоцентровое исследование». J. Аутоиммунный. 20 (3): 247–54. Дои:10.1016 / S0896-8411 (03) 00033-7. PMID  12753810.
20. Йошима Т., Юра Т., Янаги Х. (ноябрь 1997 г.). «Домен тримеризации фактора теплового шока 2 человека способен взаимодействовать с нуклеопорином p62». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 240 (1): 228–33. Дои:10.1006 / bbrc.1997.7662. PMID  9367915.
21. Бен-Эфраим I, Джерас Л. (январь 2001 г.). «Градиент увеличения сродства импортина бета к нуклеопоринам на пути ядерного импорта». J. Cell Biol. 152 (2): 411–7. Дои:10.1083 / jcb.152.2.411. ЧВК  2199621. PMID  11266456.
22. Ху Т., Гуань Т., Джерас Л. (август 1996 г.). «Молекулярная и функциональная характеристика комплекса p62, сборки гликопротеинов комплекса ядерных пор». J. Cell Biol. 134 (3): 589–601. Дои:10.1083 / jcb.134.3.589. ЧВК  2120945. PMID  8707840.
23. Паскаль Б.М., Джерас Л. (май 1995 г.). «Идентификация NTF2, цитозольного фактора ядерного импорта, который взаимодействует с белком комплекса ядерных пор p62». J. Cell Biol. 129 (4): 925–37. Дои:10.1083 / jcb.129.4.925. ЧВК  2120498. PMID  7744965.
24. Гампер C, ван Эйндховен WG, Schweiger E, Mossbacher M, Koo B, Lederman S (2000). «TRAF-3 взаимодействует с нуклеопорином p62, компонентом центральной пробки ядерной поры, которая связывает классические NLS-содержащие импортные комплексы». Мол. Иммунол. 37 (1–2): 73–84. Дои:10.1016 / S0161-5890 (00) 00015-8. PMID  10781837.
25. Келенбах Р., Дикманнс А., Келенбах А., Гуан Т., Джерас Л. (май 1999 г.). «Роль RanBP1 в высвобождении CRM1 из комплекса ядерных пор на конечном этапе ядерного экспорта». J. Cell Biol. 145 (4): 645–57. Дои:10.1083 / jcb.145.4.645. ЧВК  2133185. PMID  10330396.
26. Линдси М.Э., Холаска Дж.М., Велч К., Паскаль Б.М., Макара И.Г. (июнь 2001 г.). «Ran-связывающий белок 3 является кофактором для Crm1-опосредованного экспорта ядерного белка». J. Cell Biol. 153 (7): 1391–402. Дои:10.1083 / jcb.153.7.1391. ЧВК  2150735. PMID  11425870.

дальнейшее чтение

• Стоффлер Д., Фаренкрог Б., Эби Ю. (1999). «Комплекс ядерных пор: от молекулярной архитектуры к функциональной динамике». Curr. Мнение. Cell Biol. 11 (3): 391–401. Дои:10.1016 / S0955-0674 (99) 80055-6. PMID  10395558.
• Гита Т., Вутен М.В. (2002). «Структура и функциональные свойства убиквитин-связывающего белка р62». FEBS Lett. 512 (1–3): 19–24. Дои:10.1016 / S0014-5793 (02) 02286-X. PMID  11852044. S2CID  22029085.
• Кармо-Фонсека М., Керн Х., Hurt EC (1991). «Человеческий нуклеопорин p62 и основной белок ядерных пор дрожжей NSP1 демонстрируют гомологию последовательностей и сходную доменную организацию». Евро. J. Cell Biol. 55 (1): 17–30. PMID  1915414.
• Паскаль Б.М., Джерас Л. (1995). «Идентификация NTF2, цитозольного фактора ядерного импорта, который взаимодействует с белком комплекса ядерных пор p62». J. Cell Biol. 129 (4): 925–37. Дои:10.1083 / jcb.129.4.925. ЧВК  2120498. PMID  7744965.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Гроте М., Кубичек У., Райхельт Р., Петерс Р. (1996). «Картирование нуклеопоринов в центре комплекса ядерной поры с помощью электронной микроскопии иммунного золота». J. Cell Sci. 108 (9): 2963–72. PMID  8537436.
• Гуан Т., Мюллер С., Клир Г., Панте Н., Блевитт Дж. М., Ханер М., Паскаль Б., Эби Ю., Джерас Л. (1996). «Структурный анализ комплекса p62, сборки O-связанных гликопротеинов, который располагается вблизи центрального закрытого канала комплекса ядерных пор». Мол. Биол. Клетка. 6 (11): 1591–603. Дои:10.1091 / mbc.6.11.1591. ЧВК  301313. PMID  8589458.
• Пак И., Чанг Дж., Уолш К. Т., Юн И, Строминджер Дж. Л., Шин Дж. (1996). «Фосфотирозин-независимое связывание белка массой 62 кДа с доменом src homology 2 (SH2) p56lck и его регуляция путем фосфорилирования Ser-59 в уникальной N-концевой области lck». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 92 (26): 12338–42. Дои:10.1073 / пнас.92.26.12338. ЧВК  40352. PMID  8618896.
• Джунг И., Строминджер Дж. Л., Шин Дж. (1996). «Молекулярное клонирование фосфотирозин-независимого лиганда SH2 домена p56lck». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 93 (12): 5991–5. Bibcode:1996PNAS ... 93.5991J. Дои:10.1073 / pnas.93.12.5991. ЧВК  39176. PMID  8650207.
• Вадламуди Р.К., Джунг И., Строминджер Д.Л., Шин Дж. (1996). «p62, фосфотирозин-независимый лиганд SH2-домена p56lck, принадлежит к новому классу убиквитин-связывающих белков». J. Biol. Chem. 271 (34): 20235–7. Дои:10.1074 / jbc.271.34.20235. PMID  8702753.
• Ху Т, Гуань Т, Джерас Л. (1996). «Молекулярная и функциональная характеристика комплекса p62, сборки гликопротеинов комплекса ядерных пор». J. Cell Biol. 134 (3): 589–601. Дои:10.1083 / jcb.134.3.589. ЧВК  2120945. PMID  8707840.
• Баллок Т.Л., Кларксон В.Д., Кент Х.М., Стюарт М. (1996). «Кристаллическая структура с разрешением 1,6 ангстрем ядерного транспортного фактора 2 (NTF2)». J. Mol. Биол. 260 (3): 422–31. Дои:10.1006 / jmbi.1996.0411. PMID  8757804.
• Percipalle P, Кларксон WD, Кент HM, Rhodes D, Stewart M (1997). «Молекулярные взаимодействия между гетеродимером импортина альфа / бета и белками, участвующими в импорте ядерного белка позвоночных». J. Mol. Биол. 266 (4): 722–32. Дои:10.1006 / jmbi.1996.0801. PMID  9102465.
• Ясин Н.Р., Блобель Г. (1997). «Клонирование и характеристика кариоферина β3 человека». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 94 (9): 4451–6. Bibcode:1997PNAS ... 94.4451Y. Дои:10.1073 / пнас.94.9.4451. ЧВК  20743. PMID  9114010.
• Йошима Т, Юра Т, Янаги Х (1997). «Домен тримеризации фактора теплового шока 2 человека способен взаимодействовать с нуклеопорином p62». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 240 (1): 228–33. Дои:10.1006 / bbrc.1997.7662. PMID  9367915.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Келенбах Р.Х., Дикманнс А., Келенбах А., Гуан Т., Джерас Л. (1999). «Роль RanBP1 в высвобождении CRM1 из ядерного порового комплекса на заключительном этапе ядерного экспорта». J. Cell Biol. 145 (4): 645–57. Дои:10.1083 / jcb.145.4.645. ЧВК  2133185. PMID  10330396.
• Санз Л., Санчес П., Лаллена М.Дж., Диас-Меко М.Т., Москат Дж. (1999). «Взаимодействие p62 с RIP связывает атипичные PKC с активацией NF-kappaB». EMBO J. 18 (11): 3044–53. Дои:10.1093 / emboj / 18.11.3044. ЧВК  1171386. PMID  10356400.
• Рачубинский Р.А., Маркус С.Л., Капоне Дж. П. (1999). «Белок, взаимодействующий с p56 (lck), p62 стимулирует транскрипцию через энхансер SV40». J. Biol. Chem. 274 (26): 18278–84. Дои:10.1074 / jbc.274.26.18278. PMID  10373430.