ODC1 - ODC1

ODC1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2OO0, 4ZGY, 5BWA, 1D7K, 2ON3
Идентификаторы
Псевдонимы	ODC1, ODC, орнитиндекарбоксилаза 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 165640 MGI: 97402 ГомолоГен: 1906 Генные карты: ODC1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2п25.1 Начинать 10,439,968 бп[1] Конец 10,448,327 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 12 (мышь)[2] Группа 12 A1.1 | 12 8,11 см Начинать 17,544,794 бп[2] Конец 17,551,505 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность орнитиндекарбоксилазы • GO: 0001948 связывание с белками • активность гомодимеризации белков • карбокси-лиазная активность • каталитическая активность • лиазная активность Сотовый компонент • перинуклеарная область цитоплазмы • цитозоль • цитоплазма • клеточный компонент Биологический процесс • процесс биосинтеза путресцина • процесс биосинтеза полиамина • ответ на вирус • метаболический процесс полиамина • регуляция клеточного обмена аминокислот • положительное регулирование пролиферации клеток • развитие почек • регуляция белкового катаболического процесса • процесс биосинтеза путресцина из орнитина Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	4953	18263
Ансамбль	ENSG00000115758	ENSMUSG00000011179
UniProt	P11926	P00860
RefSeq (мРНК)	NM_002539 NM_001287188 NM_001287189 NM_001287190	NM_013614
RefSeq (белок)	NP_001274117 NP_001274118 NP_001274119 NP_002530	NP_038642
Расположение (UCSC)	Chr 2: 10.44 - 10.45 Мб	Chr 12: 17.54 - 17.55 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Орнитин декарбоксилаза является фермент что у людей кодируется ODC1 ген.

Этот ген кодирует ограничивающий скорость фермент полиамин путь биосинтеза, который катализирует орнитин к путресцин. Уровень активности фермента варьируется в ответ на стимулы, стимулирующие рост, и демонстрирует высокую скорость обмена по сравнению с другими млекопитающими. белки. Первоначально локализованный на обеих хромосомах 2 и 7, было установлено, что ген, кодирующий этот фермент, расположен на 2p25 с псевдоген расположен по адресу 7q31-qter.^[5]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000115758 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000011179 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Энтрез Ген: ODC1 орнитиндекарбоксилаза 1».

дальнейшее чтение

• Пегг А.Е. (май 2006 г.). «Регулирование орнитиндекарбоксилазы». Журнал биологической химии. 281 (21): 14529–32. Дои:10.1074 / jbc.R500031200. PMID  16459331.
• Йошида М., Хаяси Х, Тайра М., Исоно К. (декабрь 1992 г.). «Повышенная экспрессия гена орнитиндекарбоксилазы при раке пищевода человека». Исследования рака. 52 (23): 6671–5. PMID  1423312.
• Moshier JA, Osborne DL, Skunca M, Dosescu J, Gilbert JD, Fitzgerald MC и др. (Май 1992 г.). «Множественные промоторные элементы регулируют экспрессию гена орнитиндекарбоксилазы человека в клетках карциномы толстой кишки». Исследования нуклеиновых кислот. 20 (10): 2581–90. Дои:10.1093 / nar / 20.10.2581. ЧВК  312396. PMID  1598217.
• Hickok NJ, Wahlfors J, Crozat A., Halmekytö M, Alhonen L, Jänne J, Jänne OA (сентябрь 1990 г.). «Локусы, кодирующие орнитиндекарбоксилазу человека: нуклеотидная последовательность экспрессируемого гена и характеристика псевдогена». Ген. 93 (2): 257–63. Дои:10.1016 / 0378-1119 (90) 90233-Н. PMID  2227439.
• Сие Дж. Т., Деннинг М. Ф., Хайдель С. М., Верма А. К. (апрель 1990 г.). «Экспрессия гена орнитиндекарбоксилазы хромосомы 2 человека в клетках яичника китайского хомячка с дефицитом орнитиндекарбоксилазы». Исследования рака. 50 (8): 2239–44. PMID  2317811.
• Мошьер Дж. А., Гилберт Дж. Д., Скунка М., Досеску Дж., Альмодовар К. М., Лук Г. Д. (март 1990 г.). «Выделение и экспрессия гена орнитиндекарбоксилазы человека». Журнал биологической химии. 265 (9): 4884–92. PMID  2318872.
• Веррандо П., Джухлин Л., Лакур Дж. П., Ортон Дж. П. (апрель 1987 г.). «Иммуногистохимическая локализация орнитиндекарбоксилазы в коже человека». Журнал дерматологии. 14 (2): 112–7. Дои:10.1111 / j.1346-8138.1987.tb03542.x. PMID  2440930. S2CID  39626267.
• ван Стиг Х., ван Остром К. Т., Мартенс Дж. В., ван Крейл С., Шепенс Дж., Виринга Б. (ноябрь 1989 г.). «Нуклеотидная последовательность гена орнитиндекарбоксилазы человека». Исследования нуклеиновых кислот. 17 (21): 8855–6. Дои:10.1093 / nar / 17.21.8855. ЧВК  335049. PMID  2587220.
• Фицджеральд М.С., Фланаган Массачусетс (ноябрь 1989 г.). «Характеристика и анализ последовательности гена орнитиндекарбоксилазы человека». ДНК. 8 (9): 623–34. Дои:10.1089 / dna.1.1989.8.623. PMID  2693021.
• Алхонен-Хонгисто Л., Лейнонен П., Синервирта Р., Лайне Р., Винквист Р., Алитало К. и др. (Февраль 1987 г.). «Гены орнитиндекарбоксилазы мыши и человека. Полиморфизм метилирования и амплификация». Биохимический журнал. 242 (1): 205–10. Дои:10.1042 / bj2420205. ЧВК  1147684. PMID  3036086.
• Kaczmarek L, Calabretta B, Ferrari S, de Riel JK (сентябрь 1987 г.). «Зависимая от клеточного цикла экспрессия орнитиндекарбоксилазы человека». Журнал клеточной физиологии. 132 (3): 545–51. Дои:10.1002 / jcp.1041320318. PMID  3308908. S2CID  45689962.
• Hickok NJ, Seppänen PJ, Gunsalus GL, Jänne OA (июнь 1987 г.). «Полная аминокислотная последовательность орнитиндекарбоксилазы человека, полученная из комплементарной ДНК». ДНК. 6 (3): 179–87. Дои:10.1089 / dna.1987.6.179. PMID  3595418.
• Винквист Р., Мякеля Т.П., Сеппянен П., Янне О.А., Алхонен-Хонгисто Л., Янне Дж. И др. (1986). «Последовательности орнитиндекарбоксилазы человека отображаются на хромосомные области 2pter ---- p23 и 7cen ---- qter, но не коамплифицированы с онкогеном NMYC». Цитогенетика и клеточная генетика. 42 (3): 133–40. Дои:10.1159/000132266. PMID  3755388.
• Като С., Секин С., О С.В., Ким Н.С., Умедзава И., Абэ Н. и др. (Декабрь 1994 г.). «Строительство банка полноразмерных кДНК человека». Ген. 150 (2): 243–50. Дои:10.1016/0378-1119(94)90433-2. PMID  7821789.
• Ким Й.Дж., Пан Х., Верма А.К. (июль 1994 г.). «Последовательности, реагирующие на 12-O-тетрадеканоилфорбол-13-ацетат не-AP-1 опухолевого промотора в гене орнитиндекарбоксилазы человека». Молекулярный канцерогенез. 10 (3): 169–79. Дои:10.1002 / mc.2940100308. PMID  8043198. S2CID  12159876.
• Мюллер М., Паюнен А.Е., Ярвинен М., Поеггель Г., Бернштейн Х.Г. (1994). «Иммуногистохимическая демонстрация белка фермента L-орнитиндекарбоксилазы в различных областях развивающегося мозга человека». Развитие нейробиологии. 15 (2): 87–93. Дои:10.1159/000111320. PMID  8168440.
• Ичиба Т., Мацуфудзи С., Миядзаки Ю., Мураками Ю., Танака К., Итихара А., Хаяси С. (май 1994 г.). «Функциональные области антизима орнитиндекарбоксилазы». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 200 (3): 1721–7. Дои:10.1006 / bbrc.1994.1651. PMID  8185631.
• Райт PS, Купер JR, Cross-Doersen DE, Miller JA, Chmielewski PA, Wagner RL, et al. (Сентябрь 1995 г.). «Регулирование уровней мРНК орнитиндекарбоксилазы в клетках рака молочной железы человека: паттерн экспрессии и участие основного элемента промотора энхансера». Рост и дифференциация клеток. 6 (9): 1097–102. PMID  8519686.
• Heiskala M, Zhang J, Hayashi S, Hölttä E, Andersson LC (март 1999 г.). «Транслокация орнитиндекарбоксилазы к поверхностной мембране во время активации и трансформации клеток». Журнал EMBO. 18 (5): 1214–22. Дои:10.1093 / emboj / 18.5.1214. ЧВК  1171212. PMID  10064588.
• Помидор М.М., Чимилдоро Р., Лазатин Б., Чжэн П., Гурр Дж. А., Ли И. М. и др. (Декабрь 1999 г.). «Фосфорилированная орнитиндекарбоксилаза кератиноцитов человека предпочтительно связана с нерастворимыми клеточными белками». Молекулярная биология клетки. 10 (12): 4299–310. Дои:10.1091 / mbc.10.12.4299. ЧВК  25759. PMID  10588659.
• Саймс А.Дж., Эйлерцен М., Миллар М., Нарикулам Дж., Фриман А., Нотара М. и др. (2013). «Количественный анализ сверхэкспрессии белков BTF3, HINT1, NDRG1 и ODC1 в ткани рака простаты человека». PLOS One. 8 (12): e84295. Дои:10.1371 / journal.pone.0084295. ЧВК  3874000. PMID  24386364.