ПЛЕХО1 - PLEKHO1

ПЛЕХО1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3AA1
Идентификаторы
Псевдонимы	ПЛЕХО1, CKIP-1, OC120, CKIP1, JBP, домен гомологии плекстрина, содержащий O1
Внешние идентификаторы	OMIM: 608335 MGI: 1914470 ГомолоГен: 9448 Генные карты: ПЛЕХО1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q21.2 Начните 150,149,183 бп[1] Конец 150,164,720 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 | 3 F2.1 Начните 95,988,429 бп[2] Конец 95,996,001 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • цитоплазма • мембрана с оборками • клеточная мембрана • проекционная мембрана мышечных клеток • мембрана • ядро клетки Биологический процесс • миграция миобластов • слияние миобластов • морфогенез ламеллиподии • регулировка формы клеток Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	51177	67220
Ансамбль	ENSG00000023902	ENSMUSG00000015745
UniProt	Q53GL0	Q9JIY0
RefSeq (мРНК)	NM_016274 NM_001304722 NM_001304723 NM_001304724	NM_023320
RefSeq (белок)	NP_001291651 NP_001291652 NP_001291653 NP_057358	NP_075809
Расположение (UCSC)	Chr 1: 150.15 - 150.16 Мб	Chr 3: 95.99 - 96 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Семейство O, содержащее гомологичный домен плэкстрина, член 1 это белок что у людей кодируется ПЛЕХО1 ген.^[5][6]

Взаимодействия

PLEKHO1 был показан взаимодействовать с Казеинкиназа 2, альфа 1^[5] и SMURF1.^[7]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000023902 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015745 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Bosc DG, Graham KC, Saulnier RB, Zhang C, Prober D, Gietz RD, Litchfield DW (май 2000 г.). «Идентификация и характеристика CKIP-1, нового белка, содержащего домен гомологии плекстрина, который взаимодействует с протеинкиназой CK2». Журнал биологической химии. 275 (19): 14295–306. Дои:10.1074 / jbc.275.19.14295. PMID  10799509.
6. "Ген Entrez: домен гомологии плекстрина PLEKHO1, член 1 семейства O".
7. Лу К., Инь X, Вен Т, Си С., Ли Л., Син Дж, Ченг Х, Ян Х, Чжан Л., Хэ Ф (август 2008 г.). «Нацеливание на линкер WW-доменов убиквитинлигазы HECT-типа Smurf1 для активации с помощью CKIP-1». Природа клеточной биологии. 10 (8): 994–1002. Дои:10,1038 / ncb1760. PMID  18641638.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Геномные исследования. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Ольстен, МЭ, Кантон, Округ Колумбия, Чжан К., Уолтон, Пенсильвания, Литчфилд, DW (октябрь 2004 г.). «Домен гомологии плэкстрина белка-1, взаимодействующего с CK2, необходим для взаимодействий и рекрутирования протеинкиназы CK2 на плазматическую мембрану». Журнал биологической химии. 279 (40): 42114–27. Дои:10.1074 / jbc.M407628200. PMID  15254037.
• Wiemann S, Arlt D, Huber W., Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Геномные исследования. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Чжан Л., Син Г, Ти И, Тан И, Тянь Ц, Ли Л., Сунь Л., Вэй Х, Чжу Й, Хэ Ф (февраль 2005 г.). «Роль белка CKIP-1, содержащего домен гомологии плекстрина, в регуляции AP-1 и апоптозе». Журнал EMBO. 24 (4): 766–78. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600532. ЧВК  549613. PMID  15706351.
• Барриос-Родилес М., Браун К. Р., Оздамар Б., Бозе Р., Лю З., Донован Р. С., Синджо Ф., Лю Ю., Дембовы Дж., Тейлор И. В., Луга В., Прзуль Н., Робинсон М., Сузуки Н., Хаяшизаки Ю., Юрисика И. Wrana JL (март 2005 г.). «Высокопроизводительное отображение динамической сигнальной сети в клетках млекопитающих». Наука. 307 (5715): 1621–5. Bibcode:2005Научный ... 307.1621B. Дои:10.1126 / science.1105776. PMID  15761153.
• Кантон Д.А., Олстен М.Э., Ким К., Доэрти-Кирби А., Ладжуа Дж., Купер Д.А., Литчфилд Д.В. (май 2005 г.). «Белок CKIP-1, содержащий домен гомологии плекстрина, участвует в регуляции морфологии клеток и актинового цитоскелета, а также во взаимодействии с белком, блокирующим актин». Молекулярная и клеточная биология. 25 (9): 3519–34. Дои:10.1128 / MCB.25.9.3519-3534.2005. ЧВК  1084316. PMID  15831458.
• Чжан Л., Ти Й, Тянь Ц, Син Дж, Сун Й, Чжу Й, Сунь З, Хэ Ф (сентябрь 2006 г.). «CKIP-1 рекрутирует ядерный ATM частично на плазматическую мембрану посредством взаимодействия с ATM». Сотовая связь. 18 (9): 1386–95. Дои:10.1016 / j.cellsig.2005.10.017. PMID  16325375.
• Мерле А., Розенфельдер Х., Шупп И., дель Валь С., Арльт Д., Хане Ф., Бектель С., Симпсон Дж., Хофманн О., Хиде В., Глаттинг К. Х., Хубер В., Пепперкок Р., Поустка А., Виманн С. (январь 2006 г.) «База данных LIFEdb в 2006 году». Исследования нуклеиновых кислот. 34 (Проблема с базой данных): D415-8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.
• Лим Дж., Хао Т., Шоу К., Патель А.Дж., Сабо Дж., Руал Дж. Ф., Фиск С.Дж., Ли Н., Смоляр А., Хилл Д.Е., Барабаши А.Л., Видал М., Зогби Х.Ю. (май 2006 г.). «Сеть белок-белкового взаимодействия для унаследованных атаксий человека и нарушений дегенерации клеток Пуркинье». Ячейка. 125 (4): 801–14. Дои:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID  16713569.
• Canton DA, Olsten ME, Niederstrasser H, Cooper JA, Litchfield DW (ноябрь 2006 г.). «Роль CKIP-1 в морфологии клеток зависит от его взаимодействия с белком, блокирующим актин». Журнал биологической химии. 281 (47): 36347–59. Дои:10.1074 / jbc.M607595200. ЧВК  2583070. PMID  16987810.
• Чжан Л., Тан И, Ти И, Тиан Ц, Ван Дж, Донг И, Сунь З, Хе Ф (май 2007 г.). «PH-домен, содержащий белок CKIP-1, связывается с IFP35 и Nmi и участвует в передаче сигналов цитокинов». Сотовая связь. 19 (5): 932–44. Дои:10.1016 / j.cellsig.2006.11.002. PMID  17197158.
• Токуда Э, Фудзита Н., О-хара Т., Сато С., Курата А., Катаяма Р., Ито Т., Такенава Т., Миядзоно К., Цуруо Т. (октябрь 2007 г.). «Белок-1, взаимодействующий с казеинкиназой 2, новый белок, взаимодействующий с доменом гомологии плекстрина Akt, подавляет передачу сигналов PI3K / Akt и подавляет рост опухоли in vivo». Исследования рака. 67 (20): 9666–76. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-07-1050. PMID  17942896.