Белок S - Protein S

PROS1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1Z6C
Идентификаторы
Псевдонимы	PROS1, PROS, PS21, PS22, PS23, PS24, PS25, PSA, THPH5, THPH6, протеин S (альфа), протеин S
Внешние идентификаторы	OMIM: 176880 MGI: 1095733 ГомолоГен: 264 Генные карты: PROS1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3q11.1 Начинать 93,873,051 бп[1] Конец 93,980,003 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 16 (мышь)[2] Группа 16 | 16 C1.3 Начинать 62,854,307 бп[2] Конец 62,929,346 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов кальция • активность ингибитора эндопептидазы Сотовый компонент • микрочастица крови • мембрана эндоплазматического ретикулума • Мембрана Гольджи • клеточная мембрана • внеклеточная область • Просвет Гольджи • внеклеточная экзосома • просвет альфа-гранул тромбоцитов • внеклеточный Биологический процесс • гемостаз • фибринолиз • дегрануляция тромбоцитов • коагуляция крови • ER в пузырьки Гольджи-опосредованный транспорт • сигнальный пептидный процессинг • карбоксилирование пептидилглутаминовой кислоты • регуляция активации комплемента • миграция лейкоцитов • отрицательная регуляция активности эндопептидазы • отрицательная регуляция свертывания крови Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	5627	19128
Ансамбль	ENSG00000184500	ENSMUSG00000022912
UniProt	P07225	Q08761
RefSeq (мРНК)	NM_000313 NM_001314077	NM_011173
RefSeq (белок)	NP_000304 NP_001301006	NP_035303
Расположение (UCSC)	Chr 3: 93,87 - 93,98 Мб	Chr 16: 62,85 - 62,93 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок S (также известный как S-белок) это витамин К -зависимая плазма гликопротеин синтезируется в печень. В обращении белок S существует в двух формах: в свободной форме и в сложной форме, связанной с дополнять белок C4b-связывающий белок (C4BP). У человека белок S кодируется PROS1 ген.^[5][6]

История

Белок S назван в честь Сиэтла, штат Вашингтон, где он был первоначально обнаружен и очищен.^[7] к Эрл Дэви группа в 1977 году.^[8]

Структура

Белок S частично гомологичный к другим витамин К-зависимым белкам свертывания плазмы, таким как протеин C и факторы VII, IX, и Икс. Подобно им, он имеет Домен Gla и несколько EGF-подобные домены (четыре, а не два), но без домена сериновой протеазы. Вместо этого имеется большой C-концевой домен, который гомологичен белкам, связывающим стероидные гормоны плазмы, таким как глобулин, связывающий половые гормоны и кортикостероид-связывающий глобулин. Он может играть роль в функциях белка как кофактор за активированный протеин C (APC) или в привязке C4BP.^[9][10]

Кроме того, белок S имеет пептид между доменом Gla и EGF-подобным доменом, который расщепляется тромбин. Gla- и EGF-подобные домены остаются связанными после расщепления дисульфидная связь. Однако белок S теряет свою функцию кофактора APC либо после этого расщепления, либо после связывания C4BP.^[11]

Функция

Лучше всего охарактеризованная функция протеина S - это его роль в противодействии коагуляция пути, где он действует как кофактор для Белок С в инактивации Факторы Va и VIIIa. Только свободная форма имеет кофакторную активность.^[12]

Белок S связывается с отрицательно заряженными фосфолипиды через карбоксилированный домен Gla. Это свойство позволяет Protein S облегчить удаление клеток, которые подвергаются апоптоз, форма структурированной гибели клеток, используемая организмом для удаления нежелательных или поврежденных клеток. В здоровых клетках АТФ (аденозинтрифосфат ) -зависимый фермент удаляет отрицательно заряженные фосфолипиды, такие как фосфатидилсерин, из наружного листка клеточной мембраны. Апоптотическая клетка (т.е. апоптоз ) больше не активно управляет распределением фосфолипидов в своей внешней мембране и, следовательно, начинает отображать отрицательно заряженные фосфолипиды на своей внешней поверхности. Эти отрицательно заряженные фосфолипиды распознаются фагоциты Такие как макрофаги. Белок S связывается с отрицательно заряженными фосфолипидами и действует как мост между апоптотической клеткой и фагоцитом. Это соединение ускоряет фагоцитоз и позволяет удалить клетку, не вызывая воспаление или другие признаки повреждения тканей.

Белок S также связывается с формирующимся комплексом комплемента C5,6,7 и предотвращает встраивание этого комплекса в мембрану. Эта функция предотвращает неправильную активацию системы комплемента, которая может вызвать неконтролируемое системное воспаление. Фактически, белок S был впервые открыт в 1977 году в этой роли и назван в честь мембраны. сайт что он занимает в комплексе.^[13]

Патология

Мутации в гене PROS1 могут привести к Дефицит протеина S это редкое заболевание крови, которое может привести к повышенному риску тромбоз.^[14][15]

Взаимодействия

Было показано, что белок S взаимодействовать с Фактор V.^[16][17]

Смотрите также

• Гемостаз

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000184500 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022912 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Lundwall A, Dackowski W, Cohen E, Shaffer M, Mahr A, Dahlbäck B., Stenflo J, Wydro R (сентябрь 1986 г.). «Выделение и последовательность кДНК человеческого белка S, регулятора свертывания крови». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 83 (18): 6716–20. Bibcode:1986PNAS ... 83.6716L. Дои:10.1073 / пнас.83.18.6716. ЧВК  386580. PMID  2944113.
6. Long GL, Marshall A, Gardner JC, Naylor SL (январь 1988 г.). «Гены витамин K-зависимых белков плазмы C и S расположены на хромосомах 2 и 3 соответственно». Сомат. Cell Mol. Genet. 14 (1): 93–8. Дои:10.1007 / BF01535052. PMID  2829367. S2CID  31236887.
7. «Дефицит протеина S». Своевременно. Получено 10 мая, 2017.
8. Каушанский, К; Lichtman, M; Прчал, Дж; Леви, М; Нажмите, O; Бернс, L; Калиджури, М (2015). Гематология Вильямса. Макгроу-Хилл. п. 1926 г.
9. Стенфло Дж (1999). «Вклады Gla и EGF-подобных доменов в функцию витамин К-зависимых факторов свертывания». Критические обзоры экспрессии эукариотических генов. 9 (1): 59–88. Дои:10.1615 / CritRevEukaryotGeneExpr.v9.i1.50. PMID  10200912.
10. Рознер В. (декабрь 1991 г.). «Стероид-связывающие белки плазмы». Клиники эндокринологии и метаболизма Северной Америки. 20 (4): 697–720. Дои:10.1016 / S0889-8529 (18) 30240-8. PMID  1778174.
11. Дальбек Б., Лундвалл А., Стенфло Дж. (Июнь 1986 г.). «Первичная структура витамин К-зависимого белка S крупного рогатого скота». Труды Национальной академии наук. 83 (12): 4199–203. Bibcode:1986PNAS ... 83.4199D. Дои:10.1073 / pnas.83.12.4199. ЧВК  323699. PMID  2940598.
12. Castoldi E, Hackeng TM (сентябрь 2008 г.). «Регулирование свертывания протеином S». Curr. Мнение. Гематол. 15 (5): 529–36. Дои:10.1097 / MOH.0b013e328309ec97. PMID  18695379. S2CID  11522770.
13. Подак, Экхард; Колб, Уильям; Мюллер-Эберхард, Ганс (1977). «Комплекс SC5b-7: образование, выделение, свойства и субъединичный состав». J. Immunol. 119 (6): 2024–2029. PMID  410885.
14. Beauchamp NJ, Dykes AC, Parikh N, Campbell Tait R, Daly ME (июнь 2004 г.). «Распространенность и молекулярные дефекты, лежащие в основе наследственной недостаточности протеина S среди населения в целом». Br. J. Haematol. 125 (5): 647–54. Дои:10.1111 / j.1365-2141.2004.04961.x. PMID  15147381. S2CID  705661.
15. Гарсия де Фрутос П., Фуэнтес-Приор П., Уртадо Б., Сала Н. (сентябрь 2007 г.). «Молекулярные основы дефицита протеина S». Тромб. Haemost. 98 (3): 543–56. Дои:10.1160 / th07-03-0199. PMID  17849042.
16. Хиб, М. Дж .; Кодзима Y; Розинг Дж; Загар G; Гриффин Дж. Х (декабрь 1999 г.). «С-концевые остатки 621-635 белка S необходимы для связывания с фактором Va». J. Biol. Chem. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 274 (51): 36187–92. Дои:10.1074 / jbc.274.51.36187. ISSN  0021-9258. PMID  10593904. S2CID  45995946.
17. Хиб, М. Дж; Mesters R M; Tans G; Розинг Дж; Гриффин Дж. Х (февраль 1993 г.). «Связывание протеина S с фактором Va, связанное с ингибированием протромбиназы, которое не зависит от активированного протеина C». J. Biol. Chem. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 268 (4): 2872–7. ISSN  0021-9258. PMID  8428962.

дальнейшее чтение

• Дальбек Б. (1991). «Белок S и C4b-связывающий белок: компоненты, участвующие в регуляции антикоагулянтной системы протеина C». Тромб. Haemost. 66 (1): 49–61. Дои:10.1055 / с-0038-1646373. PMID  1833851.
• Витт, я (2002). «Молекулярно-биологическая диагностика и наследственная диагностика антитромбина III, протеина С и протеина S» [Молекулярно-биологические основы и диагностика наследственного дефекта антитромбина III, протеина с и протеина S]. Hamostaseologie (на немецком). 22 (2): 14–24. Дои:10.1267 / Hamo02020057 (неактивно 11.10.2020). PMID  12193972. Архивировано из оригинал на 2012-03-27. Получено 2011-08-19.
• Резенде С.М., Симмондс Р.Э., Лейн Д.А. (2004). «Коагуляция, воспаление и апоптоз: разные роли белка S и белкового комплекса, связывающего белок S-C4b». Кровь. 103 (4): 1192–201. Дои:10.1182 / кровь-2003-05-1551. PMID  12907438. S2CID  133028.
• Дальбек Б. (2007). «Сказка о протеине S и C4b-связывающем протеине, история любви». Тромб. Haemost. 98 (1): 90–6. Дои:10.1160 / th07-04-0269. PMID  17597997.
• Гарсия де Фрутос П., Фуэнтес-Приор П., Уртадо Б., Сала Н. (2007). «Молекулярные основы дефицита протеина S». Тромб. Haemost. 98 (3): 543–56. Дои:10.1160 / th07-03-0199. PMID  17849042.
• Майяр С., Берруйер М., Серр С.М. и др. (1992). «Протеин-S, витамин К-зависимый белок, представляет собой компонент костного матрикса, синтезируемый и секретируемый остеобластами». Эндокринология. 130 (3): 1599–604. Дои:10.1210 / en.130.3.1599. PMID  1531628.
• Гриффин Дж. Х., Грубер А., Фернандес Дж. А. (1992). «Повторная оценка уровня общего, свободного и связанного белка S и C4b-связывающего белка в плазме, антикоагулированной цитратом или гирудином». Кровь. 79 (12): 3203–11. Дои:10.1182 / blood.V79.12.3203.bloodjournal79123203. PMID  1534488.
• Гульельмоне HA, Видес MA (1992). «Новый функциональный анализ протеина С в плазме человека и его сравнение с амидолитическим и антикоагулянтным анализами». Тромб. Haemost. 67 (1): 46–9. Дои:10.1055 / с-0038-1648377. PMID  1615482.
• Бертина Р.М., Плоос ван Амстел Х.К., ван Вейнгаарден А. и др. (1990). «Полиморфизм Херлена белка S, иммунологический полиморфизм, обусловленный диморфизмом остатка 460». Кровь. 76 (3): 538–48. Дои:10.1182 / кровь.V76.3.538.538. PMID  2143091.
• Шмидель Д.К., Татро А.В., Фелпс Л.Г. и др. (1991). «Организация генов человеческого белка S». Биохимия. 29 (34): 7845–52. Дои:10.1021 / bi00486a010. PMID  2148110.
• Ploos van Amstel HK, Reitsma PH, van der Logt CP, Bertina RM (1991). «Интрон-экзонная организация активного человеческого белка S гена PS альфа и его псевдогена PS beta: дупликация и молчание во время эволюции приматов». Биохимия. 29 (34): 7853–61. Дои:10.1021 / bi00486a011. PMID  2148111.
• Аллаарт С.Ф., Аронсон Д.К., Руйс Т. и др. (1991). «Наследственный дефицит белка S у молодых людей с артериальной окклюзионной болезнью». Тромб. Haemost. 64 (2): 206–10. PMID  2148653.
• Олин А.К., Ландес Дж., Бурдон П. и др. (1989). «Бета-гидроксиаспарагиновая кислота в первом эпидермальном факторе роста-подобном домене белка C. Ее роль в связывании Ca2 + и биологической активности». J. Biol. Chem. 263 (35): 19240–8. PMID  2461936.
• Schwarz HP, Heeb MJ, Lottenberg R, et al. (1989). «Семейный дефицит белка S с вариантом молекулы белка S в плазме и тромбоцитах». Кровь. 74 (1): 213–21. Дои:10.1182 / blood.V74.1.213.213. PMID  2526663.
• Плоос ван Амстел HK, ван дер Занден AL, Reitsma PH, Bertina RM (1987). «КДНК человеческого белка S кодирует Phe-16 и Tyr 222 в консенсусных последовательностях для посттрансляционного процессинга». FEBS Lett. 222 (1): 186–90. Дои:10.1016 / 0014-5793 (87) 80217-X. PMID  2820795. S2CID  46365357.
• Дальбек Б., Лундвалл А., Стенфло Дж. (1986). «Первичная структура витамин К-зависимого белка S крупного рогатого скота». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 83 (12): 4199–203. Bibcode:1986PNAS ... 83.4199D. Дои:10.1073 / pnas.83.12.4199. ЧВК  323699. PMID  2940598.
• Lundwall A, Dackowski W, Cohen E, et al. (1986). «Выделение и последовательность кДНК человеческого белка S, регулятора свертывания крови». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 83 (18): 6716–20. Bibcode:1986PNAS ... 83.6716L. Дои:10.1073 / пнас.83.18.6716. ЧВК  386580. PMID  2944113.
• Энгессер Л., Брукманс А.В., Бриет Э. и др. (1987). «Наследственный дефицит белка S: клинические проявления». Анна. Междунар. Med. 106 (5): 677–82. Дои:10.7326/0003-4819-106-5-677. PMID  2952034.
• Уоткинс П.К., Эдди Р., Фукусима Ю. и др. (1988). «Ген протеина S отображается около центромеры хромосомы 3 человека». Кровь. 71 (1): 238–41. Дои:10.1182 / blood.V71.1.238.238. PMID  2961379.