RABGAP1 - RABGAP1

RABGAP1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4NC6
Идентификаторы
Псевдонимы	RABGAP1, GAPCENA, TBC1D11, RAB, активирующий ГТФазу белок 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 615882 MGI: 2385139 ГомолоГен: 49301 Генные карты: RABGAP1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 9 (человек)[1] Группа 9q33.2-q33.3 Начинать 122,940,833 бп[1] Конец 123,104,866 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 | 2 млрд Начинать 37,443,279 бп[2] Конец 37,566,454 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание тубулина • Связывание Rab GTPase • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Активность активатора GTPase Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • центросома • цитоскелет • комплекс, связанный с микротрубочками • центр организации микротрубочек • эндомембранная система Биологический процесс • регуляция сборки ресничек • клеточный цикл • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase • GO: 0032861, GO: 0032862, GO: 0032856 активация активности GTPase • регуляция слияния везикул • внутриклеточный транспорт белка • GO: 0043087, GO: 0032313, GO: 0032319, GO: 0032314, GO: 0043088 регуляция активности GTPase Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	23637	227800
Ансамбль	ENSG00000011454	ENSMUSG00000035437
UniProt	Q9Y3P9	A2AWA9
RefSeq (мРНК)	NM_012197	NM_001033960 NM_146121 NM_001362956 NM_001362957 NM_001362958
RefSeq (белок)	NP_036329	NP_001029132 NP_666233 NP_001349885 NP_001349886 NP_001349887
Расположение (UCSC)	Chr 9: 122.94 - 123,1 Мб	Chr 2: 37,44 - 37,57 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

RAB GTPase, активирующий белок 1 это белок у человека, который кодируется RABGAP1 ген.^[5]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000011454 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000035437 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: белок 1, активирующий ГТФазу RAB».

дальнейшее чтение

• Карато Дж., Аллегра Д., Бимонте М., Скиаттарелла Г. Г., Д'Амброзио К., Скалони А., Наполитано М., Руссо Т., Замбрано Н. (февраль 2007 г.). «Идентификация лигандов доменов взаимодействия белков с помощью функционального подхода». Молекулярная и клеточная протеомика. 6 (2): 333–45. Дои:10.1074 / mcp.M600289-MCP200. PMID  17124247.
• Эчард А., Опдам Ф. Дж., Де Лиу Х. Дж., Джолливет Ф., Савелкул П., Хендрикс В., Вурберг Дж., Гоуд Б., Франсен Дж. А. (ноябрь 2000 г.). «Альтернативный сплайсинг человеческого гена Rab6A генерирует две близкие, но функционально разные изоформы». Молекулярная биология клетки. 11 (11): 3819–33. Дои:10.1091 / mbc.11.11.3819. ЧВК  15039. PMID  11071909.
• Ишибаши К., Канно Э, Ито Т., Фукуда М. (январь 2009 г.). «Идентификация и характеристика нового белка Tre-2 / Bub2 / Cdc16 (TBC), который обладает активностью Rab3A-GAP». Гены в клетки. 14 (1): 41–52. Дои:10.1111 / j.1365-2443.2008.01251.x. PMID  19077034. S2CID  26454981.
• Опдам Ф. Дж., Эчард А., Крус Х. Дж., Ван ден Херк Дж. А., ван де Форстенбош Р. А., Гинзель Л. А., Гоуд Б., Франсен Дж. А. (август 2000 г.). «Малая GTPase Rab6B, новый член подсемейства Rab6, является клеточным типом, специфически экспрессируемым и локализованным в аппарате Гольджи». Журнал клеточной науки. 113 (Pt 15) (15): 2725–35. PMID  10893188.
• Cuif MH, Possmayer F, Zander H, Bordes N, Jollivet F, Couedel-Courteille A, Janoueix-Lerosey I, Langsley G, Bornens M, Goud B (апрель 1999 г.). «Характеристика GAPCenA, белка, активирующего GTPase для Rab6, часть которого ассоциируется с центросомой». Журнал EMBO. 18 (7): 1772–82. Дои:10.1093 / emboj / 18.7.1772. ЧВК  1171263. PMID  10202141.