SRI (ген) - SRI (gene)

НИИ
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1JUO, 2JC2, 4U8D, 4UPG, 4USL
Идентификаторы
Псевдонимы	НИИ, CP-22, CP22, SCN, V19, сорцин
Внешние идентификаторы	OMIM: 182520 MGI: 98419 ГомолоГен: 37736 Генные карты: НИИ
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 7 (человек)[1] Группа 7q21.12 Начните 88,205,118 бп[1] Конец 88,226,993 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 A1 | 5 3,38 см Начните 8,046,078 бп[2] Конец 8,069,379 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов кальция • связывание ионного канала • активность регулятора кальциевых каналов • связывание ионов металлов • кальций-зависимая активность эндопептидазы цистеинового типа • связывание протеазы • GO: 0001948 связывание с белками • активность гетеродимеризации белков • идентичное связывание с белками • рецепторное связывание • репрессия связывания фактора транскрипции Сотовый компонент • конец аксона • дендритный позвоночник шеи • везикул • цитозоль • мембрана эндоплазматического ретикулума • мембрана • Т-трубочка • клеточная мембрана • внутриклеточный • саркоплазматический ретикулум • нуклеоплазма • гладкая эндоплазматическая сеть • аксон • мембрана хромаффинных гранул • Z диск • митохондрия • мембрана саркоплазматического ретикулума • внеклеточная экзосома • цитоплазма Биологический процесс • регулирование транспорта ионов кальция • регулирование сердечных сокращений • цитоплазматическая секвестрация фактора транскрипции • развитие мышечных органов • положительное регулирование высвобождения секвестрированного иона кальция в цитозоль • отрицательная регуляция сердечного ритма • протеолиз • отрицательная регуляция активности рианодин-чувствительных каналов высвобождения кальция • регулирование сокращения клеток сердечной мышцы • развитие сердца • внутриклеточное связывание иона железа • регулирование сокращения поперечно-полосатых мышц • отрицательная регуляция связывания ДНК регуляторной области транскрипции • регулирование активности высоковольтных кальциевых каналов • потенциал действия • положительная регуляция секреции инсулина, участвующая в клеточном ответе на стимул глюкозы • регулирование межклеточной связи посредством электрической связи • регулирование клеточной коммуникации посредством электрического взаимодействия, участвующего в сердечной проводимости • регулирование расслабления мышц • регулирование высвобождения секвестрированного иона кальция в цитозоль саркоплазматическим ретикулумом • транспорт ионов кальция • преобразование сигнала • отрицательная регуляция сокращения сердечной мышцы • транспорт Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	6717	109552
Ансамбль	ENSG00000075142	ENSMUSG00000003161
UniProt	P30626	Q6P069
RefSeq (мРНК)	NM_001256891 NM_001256892 NM_003130 NM_198901	NM_001080974 NM_025618
RefSeq (белок)	NP_001243820 NP_001243821 NP_003121 NP_944490	NP_001074443 NP_079894
Расположение (UCSC)	Chr 7: 88.21 - 88.23 Мб	Chr 5: 8.05 - 8.07 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Сорчин это белок что у людей кодируется НИИ ген.^[5][6]

Взаимодействия

Было показано, что SRI (ген) взаимодействовать с участием Рецептор рианодина 2,^[7] ANXA7^[8] и GCA.^[9]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000075142 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000003161 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ван дер Блик AM, Баас Ф., Ван дер Вельде-Кёртс Т., Бидлер Дж. Л., Мейерс М.Б., Озолс Р.Ф., Гамильтон ТК, Йоэнье Х., Борст П. (ноябрь 1988 г.). «Гены амплифицированы и сверхэкспрессируются в линиях клеток человека с множественной лекарственной устойчивостью». Исследования рака. 48 (21): 5927–32. PMID  2901906.
6. "Entrez Gene: SRI sorcin".
7. Мейерс М.Б., Пикель В.М., Шеу С.С., Шарма В.К., Скотто К.В., Фишман Г.И. (ноябрь 1995 г.). «Ассоциация сорцина с сердечным рианодиновым рецептором». Журнал биологической химии. 270 (44): 26411–8. Дои:10.1074 / jbc.270.44.26411. PMID  7592856.
8. Brownawell AM, Creutz CE (август 1997 г.). «Кальций-зависимое связывание сорцина с N-концевым доменом синексина (аннексина VII)». Журнал биологической химии. 272 (35): 22182–90. Дои:10.1074 / jbc.272.35.22182. PMID  9268363.
9. Хансен С., Тарабыкина С., Ла Кур Дж. М., Лоллик К., Берхтольд М. В. (июнь 2003 г.). «Белки семейства PEF сорцин и гранкальцин взаимодействуют in vivo и in vitro». Письма FEBS. 545 (2–3): 151–4. Дои:10.1016 / S0014-5793 (03) 00518-0. PMID  12804766. S2CID  42572647.

дальнейшее чтение

• Расмуссен Х. Х., ван Дамм Дж., Пуйпе М., Гессер Б., Селис Дж. Э., Вандекеркхов Дж. (Декабрь 1992 г.). «Микропоследовательности 145 белков, записанные в базе данных двумерных гелевых белков нормальных эпидермальных кератиноцитов человека». Электрофорез. 13 (12): 960–9. Дои:10.1002 / elps.11501301199. PMID  1286667. S2CID  41855774.
• Мейерс МБ, Пикель В.М., Шеу С.С., Шарма В.К., Скотто К.В., Фишман Г.И. (ноябрь 1995 г.). «Ассоциация сорцина с сердечным рианодиновым рецептором». Журнал биологической химии. 270 (44): 26411–8. Дои:10.1074 / jbc.270.44.26411. PMID  7592856.
• Мейерс МБ, Зампарелли С., Верзили Д., Дикер А.П., Бланк Т.Дж., Чианконе Е. (январь 1995 г.). «Кальций-зависимая транслокация сорцина к мембранам: функциональное значение в сократительной ткани». Письма FEBS. 357 (3): 230–4. Дои:10.1016/0014-5793(94)01338-2. PMID  7835417. S2CID  28133606.
• Ван С.Л., Там М.Ф., Хо Ю.С., Пай С.Х., Као М.С. (февраль 1995 г.). «Выделение и молекулярное клонирование человеческого сорцина кальций-связывающего белка в винкристин-резистентных клетках лимфомы HOB1». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия гена. 1260 (3): 285–93. Дои:10.1016 / 0167-4781 (94) 00206-я. PMID  7873602.
• Ли В.П. (январь 1996 г.). «Очистка, клонирование кДНК и экспрессия сорцина человека в винкристин-устойчивых клеточных линиях лимфомы HOB1». Архивы биохимии и биофизики. 325 (2): 217–26. Дои:10.1006 / abbi.1996.0027. PMID  8561500.
• Brownawell AM, Creutz CE (август 1997 г.). «Кальций-зависимое связывание сорцина с N-концевым доменом синексина (аннексина VII)». Журнал биологической химии. 272 (35): 22182–90. Дои:10.1074 / jbc.272.35.22182. PMID  9268363.
• Торигоэ К., Харада Т., Кусаба Х., Учиуми Т., Коно К., Грин Э.Д., Шерер С.В., Цуй Л.К., Шлессингер Д., Кувано М., Вада М. (апрель 1998 г.). «Локализация 67 экзонов на контиге YAC, охватывающем 1,5 Mb вокруг области гена множественной лекарственной устойчивости хромосомы 7q21.1 человека». Геномика. 49 (1): 14–22. Дои:10.1006 / geno.1997.5200. PMID  9570944.
• Мейерс М.Б., Пури Т.С., Чиен А.Дж., Гао Т., Сюй П.Х., Хоси М.М., Фишман Г.И. (июль 1998 г.). «Сорцин ассоциируется с порообразующей субъединицей потенциалозависимых каналов Ca2 + L-типа». Журнал биологической химии. 273 (30): 18930–5. Дои:10.1074 / jbc.273.30.18930. PMID  9668070.
• Пак-Чанг Э., Мейерс МБ, Петтингелл В.П., Мойр Р.Д., Браунавелл А.М., Ченг И., Танзи Р.Э., Ким Т.В. (май 2000 г.). «Пресенилин 2 взаимодействует с сорцином, модулятором рецептора рианодина». Журнал биологической химии. 275 (19): 14440–5. Дои:10.1074 / jbc.M909882199. PMID  10748169.
• Xie X, Dwyer MD, Swenson L, Parker MH, Botfield MC (декабрь 2001 г.). «Кристаллическая структура не содержащего кальций сорцина человека: член семейства белков руки пента-EF». Белковая наука. 10 (12): 2419–25. Дои:10.1110 / л.с. 36701. ЧВК  2374028. PMID  11714909.
• Ли Г, Тан И, Ян Ц., Чжао Ц., Чжао Х., Ван Дж., Сюэ И, Хань М., Цянь Л., Чжао Ц. (июль 2002 г.). «Экспрессия и клиническое значение гена связывающего кальций белка, связанного с растворимой устойчивостью, и гена множественной лекарственной устойчивости при лейкемии». Чжунхуа Чжун Лю За Чжи [Китайский онкологический журнал]. 24 (4): 370–4. PMID  12408767.
• Ли Г, Тан И, Ян Ц., Чжао Ц., Чжао Х., Ван Дж., Сюэ И, Хань М., Цянь Л., Чжао Ц. (июнь 2002 г.). «Экспрессия и клинические последствия гена связывающего кальций белка (сорцина), связанного с растворимой лекарственной устойчивостью, у пациентов с лейкемией». Чжунхуа Сюэ Е Сюэ За Чжи = Чжунхуа Сюэйэсюэ Зачжи. 23 (6): 293–6. PMID  12411058.
• Мейерс М.Б., Фишер А., Сунь Ю.Дж., Лопес К.М., Рохакс Т., Накамура Т.Ю., Чжоу Ю.Й., Ли П.С., Альтшульд Р.А., МакКьюн С.А., Кутзи В.А., Фишман Г.И. (август 2003 г.). «Сорцин регулирует связь возбуждения и сокращения в сердце». Журнал биологической химии. 278 (31): 28865–71. Дои:10.1074 / jbc.M302009200. PMID  12754254.
• Хансен С., Тарабыкина С., Ла Кур Дж. М., Лоллик К., Берхтольд М. В. (июнь 2003 г.). «Белки семейства PEF сорцин и гранкальцин взаимодействуют in vivo и in vitro». Письма FEBS. 545 (2–3): 151–4. Дои:10.1016 / S0014-5793 (03) 00518-0. PMID  12804766. S2CID  42572647.
• Колланд Ф., Жак Икс, Троплин В., Мужен С., Грозело С., Гамбург А., Мейл А., Войчик Дж., Легрен П., Готье Дж. М. (июль 2004 г.). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Геномные исследования. 14 (7): 1324–32. Дои:10.1101 / гр. 2334104. ЧВК  442148. PMID  15231748.
• Франк К.Ф., Бёльк Б., Динг З., Краузе Д., Хаттебур Н., Малик А., Бриксиус К., Хаджар Р.Дж., Шредер Дж., Швингер Р.Х. (апрель 2005 г.). «Избыточная экспрессия сорцина увеличивает сократимость сердца in vivo и in vitro». Журнал молекулярной и клеточной кардиологии. 38 (4): 607–15. Дои:10.1016 / j.yjmcc.2005.01.011. PMID  15808837.
• Папа С.Н., Ли И.Р. (февраль 2005 г.). «Дрожжевое двухгибридное определение белков простаты, взаимодействующих с глобулином, связывающим половые гормоны человека». Журнал стероидной биохимии и молекулярной биологии. 94 (1–3): 203–8. Дои:10.1016 / j.jsbmb.2005.01.007. PMID  15862967. S2CID  9746088.