Трепонема - Treponema

Трепонема
Спирохеты Treponema pallidum
Бледная трепонема спирохеты
Научная классификация е
Домен:Бактерии
Тип:Спирохеты
Заказ:Спирохеталес
Семья:Спирохетовые
Род:Трепонема
Schaudinn 1905 исправить. Abt, Göker И Кленк 2013
Разновидность[1]
Синонимы
  • "Спиронема" Vuillemin 1905 г. Клебс 1892 без Леже и Гессен 1922 без Рафинский 1838 нет Hochst. 1842 г. не Линдли 1840 г. не кроткий 1864 г.
  • "Микроспиронема" Стайлз и Pfender 1905

Трепонема это род спиралевидный бактерии. Основными видами трепонем патогенов человека являются: Бледная трепонема, подвиды которых вызывают такие заболевания, как сифилис, Bejel, и фрамбезия. Treponema carateum является причиной пинта.[2] Treponema paraluiscuniculi связан с сифилисом в кролики.[3] Treponema succinifaciens был обнаружен в кишечном микробиоме традиционных сельских жителей.[4]

Филогения

Филогения основана на высвобождении 123 LTP на основе 16S рРНК Проект "Все виды живого дерева".[5]

Т. кальдариум (Pohlschroeder et al. 1995) Abt, Göker & Klenk 2013

Т. stenostreptum (Zuelzer 1912) Abt, Göker & Klenk 2013

Т. isoptericolens Dröge et al. 2008 г.

Т. азотонутрициум Graber et al. 2004 г.

T. primitia Graber et al. 2004 г.

T. zuelzerae (бывший Veldkamp 1960) Canale-Parola 1980 исправить. Abt, Göker & Klenk, 2013 г.

Т. средний

Т. м. BovisEvans et al. 2006 г.

Т. м. среднийУмемото и др. 1997 г.

T. pedis Evans et al. 2009 г.

T. denticola (ex Flügge 1886) Chan et al. 1993 г.

T. putidum Wyss et al. 2004 г.

T. lecithinolyticum Wyss et al. 1999 г.

T. maltophilum Wyss et al. 1996 г.

T. brennaborense Schrank et al. 1999 г.

Т. saccharophilum Пастер и Канале-Парола 1986

T. berlinense Nordhoff et al. 2005 г.

Т. пектиноворум Смиберт и Бурмейстер, 1983 г.

T. bryantii Стэнтон и Канале-Парола 1980

T. porcinum Nordhoff et al. 2005 г.

Т. succinifaciens Cwyk и Canale-Parola 1981

T. parvum Wyss et al. 2001 г.

Т. amylovorum Wyss et al. 1997 г.

Т. сокранский

Т. с. Паредис Smibert et al. 1984

Т. с. буккале Smibert et al. 1984

Т. с. Сокранский Smibert et al. 1984

Таксономия

В настоящее время принятая таксономия основана на Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN)[6] и Национальный центр биотехнологической информации (NCBI).[7]

Примечания:
♦ Тип штамма утерян или недоступен
♠ Штаммы, обнаруженные на Национальный центр биотехнологической информации (NCBI), но не указаны в Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LSPN)
♥ Штаммы, не попавшие в Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) или перечисленные в Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN)

Виды Treponema hyodysenteriae и Treponema innocens были реклассифицированы в Serpulina hyodysenteriae и Серпулина невинная.[8]

Рекомендации

  1. ^ "Трепонема" (HTML). Таксономия NCBI. Bethesda, MD: Национальный центр биотехнологической информации.. Получено 27 февраля 2019.
  2. ^ Antal GM, Lukehart SA, Meheus AZ (январь 2002 г.). «Эндемические трепонематозы». Микробы заражают. 4 (1): 83–94. Дои:10.1016 / S1286-4579 (01) 01513-1. PMID  11825779.
  3. ^ Харпер К.Н., Лю Х., Окампо П.С. и др. (Август 2008 г.). "Последовательность гена кислого повторяющегося белка (arp) отличает венерический от не венерического Бледная трепонема подвид, и ген развился в результате сильного положительного отбора в подвиде, вызывающем сифилис ". ФЭМС Иммунол. Med. Микробиол. 53 (3): 322–32. Дои:10.1111 / j.1574-695X.2008.00427.x. PMID  18554302. Архивировано из оригинал на 2013-01-05.
  4. ^ Ангелакис Э., Бачар Д., Ясир М., Муссо Д., Джоссу Ф., Габорит Б. и др. (Январь 2019). «Виды Treponema обогащают кишечную микробиоту традиционных сельских жителей, но отсутствуют у городских жителей». Новые микробы и новые инфекции. 27: 14–21. Дои:10.1016 / j.nmni.2018.10.009. ЧВК  6276622. PMID  30555706.
  5. ^ Проект "Все виды живого дерева".«Релиз 123 LTP на основе 16S рРНК (полное дерево)» (PDF). Комплексная база данных рибосомных РНК Silva. Получено 2013-03-20.
  6. ^ J.P. Euzéby. "Трепонема". Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN). Получено 2016-03-20.
  7. ^ Сэйерс; и другие. "Трепонема". Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) база данных таксономии. Получено 2016-03-20.
  8. ^ Стэнтон ТБ, Дженсен Н.С., Кейси Т.А., Тордофф Л.А., Дьюхерст Ф.И., Пастер Б.Дж. (январь 1991 г.). "Реклассификация Treponema hyodysenteriae и Treponema innocens в новом роде Serpula gen. nov., как Serpula hyodysenteriae comb. ноя и Serpula innocens comb. ноя ". Int. J. Syst. Бактериол. 41 (1): 50–8. Дои:10.1099/00207713-41-1-50. PMID  1704792.