VPS39 - VPS39

VPS39
Идентификаторы
Псевдонимы	VPS39, TLP, VAM6, hVam6p, субъединица комплекса HOPS, субъединица VPS39 комплекса HOPS
Внешние идентификаторы	OMIM: 612188 MGI: 2443189 ГомолоГен: 41025 Генные карты: VPS39
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 15 (человек)[1] Группа 15q15.1 Начинать 42,158,701 бп[1] Конец 42,208,316 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 | 2 E5 Начинать 120,316,461 бп[2] Конец 120,353,137 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	23339	269338
Ансамбль	ENSG00000166887	ENSMUSG00000027291
UniProt	Q96JC1	Q8R5L3
RefSeq (мРНК)	NM_001301138 NM_015289	NM_147153 NM_178851 NM_001363053 NM_001363054
RefSeq (белок)	NP_001288067 NP_056104	NP_671495 NP_849182 NP_001349982 NP_001349983
Расположение (UCSC)	Chr 15: 42.16 - 42.21 Мб	Chr 2: 120.32 - 120.35 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

hVamp6 / Vps39-подобный белок это белок что у людей кодируется VPS39 ген.^[5][6]

Этот ген кодирует белок, который может способствовать кластеризации и слиянию поздних эндосом и лизосом. Белок также может действовать как адаптерный белок, который модулирует ответ трансформирующего фактора роста-бета путем связывания рецепторного комплекса трансформирующего фактора роста-бета с сигнальным путем Smad.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000166887 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027291 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Caplan S, Hartnell LM, Aguilar RC, Naslavsky N, Bonifacino JS (июль 2001 г.). «Человеческий Vam6p способствует кластеризации и слиянию лизосом in vivo». J Cell Biol. 154 (1): 109–122. Дои:10.1083 / jcb.200102142. ЧВК  2196876. PMID  11448994.
6. «Ген Entrez: гомолог сортирующего 39 вакуолярного белка VPS39 (S. cerevisiae)».

дальнейшее чтение

• Накадзима Д., Окадзаки Н., Ямакава Н. и др. (2003). «Конструирование готовых к экспрессии клонов кДНК для генов KIAA: ручное культивирование 330 клонов кДНК KIAA». ДНК Res. 9 (3): 99–106. Дои:10.1093 / днарес / 9.3.99. PMID  12168954.
• Нагасе Т., Исикава К., Суяма М. и др. (1999). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XI. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 5 (5): 277–286. Дои:10.1093 / днарес / 5.5.277. PMID  9872452.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–1795. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–435. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–16903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Felici A, Wurthner JU, Parks WT, et al. (2003). «TLP, новый модулятор передачи сигналов TGF-бета, оказывает противоположное влияние на Smad2- и Smad3-зависимую передачу сигналов». EMBO J. 22 (17): 4465–4477. Дои:10.1093 / emboj / cdg428. ЧВК  202370. PMID  12941698.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–2127. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–2144. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–1178. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514.
• Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Проблема с базой данных): D415 – D418. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.