Эфрин B3 - Ephrin B3

EFNB3
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4BKF
Идентификаторы
Псевдонимы	EFNB3, EFL6, EPLG8, LERK8, эфрин B3
Внешние идентификаторы	OMIM: 602297 MGI: 109196 ГомолоГен: 1076 Генные карты: EFNB3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17p13.1 Начните 7,705,202 бп[1] Конец 7,711,372 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 B3 | 11 42,8 см Начните 69,554,092 бп[2] Конец 69,560,205 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание рецептора эфрина • активность трансмембранных рецепторов эфрина • активность рецептора вируса • активность протеинтирозинкиназы Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • мембрана • клеточная мембрана • моховое волокно гиппокампа к синапсу CA3 • глутаматергический синапс • неотъемлемый компонент пресинаптической мембраны • неотъемлемый компонент постсинаптической плотной мембраны Биологический процесс • сигнальный путь рецептора эфрина • развитие многоклеточного организма • передача сигналов от клетки к клетке • вирусное проникновение • Костимуляция Т-клеток • дифференциация клеток • GO: 0022415 вирусный процесс • распознавание точки выбора аксона • развитие нервной системы • поведение взрослых при ходьбе • управление аксоном • фосфорилирование пептидилтирозина • отрицательная регуляция аксоногенеза • транс-синаптическая передача сигналов посредством транс-синаптического комплекса, модулирующая синаптическую передачу Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	1949	13643
Ансамбль	ENSG00000108947	ENSMUSG00000003934
UniProt	Q15768	O35393
RefSeq (мРНК)	NM_001406	NM_007911
RefSeq (белок)	NP_001397	NP_031937
Расположение (UCSC)	Chr 17: 7.71 - 7.71 Мб	Chr 11: 69,55 - 69,56 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Эфрин-В3 это белок что у людей кодируется EFNB3 ген.^[5][6]

EFNB3, член эфрин семейство генов, важно как для развития мозга, так и для его поддержания. Рецепторы, связанные с EPH и EPH, составляют самое большое подсемейство рецепторные протеин-тирозинкиназы. Рецепторы EPH обычно имеют один киназа домен и внеклеточная область, содержащая богатый цистеином домен и 2 повтора фибронектина типа III. Лиганды и рецепторы эфрина были названы Номенклатурным комитетом Eph (1997) на основании их структур и взаимосвязей последовательностей. Эфрины делятся на класс эфрина-A (EFNA), которые прикреплены к мембране с помощью гликозилфосфатидилинозитол связь и класс эфрина-B (EFNB), которые являются трансмембранными белками. Лиганды эфрина-B также содержат внутриклеточный хвост с высококонсервативным тирозин остатков и PDZ-связывающий мотив на C-конец.^[7] Этот хвост функционирует как механизм обратной передачи сигналов, при котором передача сигналов происходит в клетку, содержащую лиганд, в отличие от клетки с рецептором. При взаимодействии рецептор-лиганд остатки тирозина фосфорилируются, и происходит рекрутирование PDZ домен -содержащие белки.^[7] Семейство рецепторов Eph аналогично разделено на две группы на основании сходства последовательностей их внеклеточных доменов и их сродства к связыванию лигандов эфрина-A и эфрина-B.^[6]EphrinB3 участвует в опосредовании различных событий развития, особенно в нервная система. Обратная передача сигналов EphrinB3 важна для отсечения аксонов и формирования синапсов и шипов во время постнатального развития нервной системы.^[8][9] Предыдущая работа также показала, что передача сигналов через этот лиганд важна для радиальной миграции во время кортикального развития.^[8] Более того, уровни экспрессии EFNB3 особенно высоки в нескольких передний мозг субрегионов по сравнению с другими подобластями мозга, и могут играть ключевую роль в функции переднего мозга. Было высказано предположение, что передача сигналов ephrinB3 необходима для синаптическая пластичность происходить в гиппокамп; это подразумевает, что ephrinB3 играет важную роль в обучении и памяти.^[9] Совсем недавно было показано, что эфринB3 регулирует пролиферацию нервные стволовые клетки во взрослом субвентрикулярная зона (СВЗ).^[8][10]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000108947 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000003934 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Тан XX, Pleasure DE, Ikegaki N (май 1997 г.). «Клонирование кДНК, хромосомная локализация и паттерн экспрессии EPLG8, нового члена семейства генов EPLG, кодирующих лиганды рецепторов протеин-тирозинкиназ, связанных с EPH». Геномика. 41 (1): 17–24. Дои:10.1006 / geno.1997.4615. PMID  9126477.
6. «Энтрез Ген: EFNB3, эфрин-B3».
7. Кляйн, Рюдигер (15 ноября 2012 г.). «Передача сигналов эфрина / эфрина во время развития». Развитие. 139 (22): 4105–9. Дои:10.1242 / dev.074997. PMID  23093422.
8. Роджер, Дженнифер; Лорена Сальваторе; Паоло Мигани (2012). «Остаться или уйти? Эфс и Эфрин в миграции нейронов». Нейросигналы. 20 (3): 190–201. Дои:10.1159/000333784. PMID  22456188.
9. Хруска, Мартин; Мэтью Б. Далва (2012). «Эфриновая регуляция образования, функции и пластичности синапсов». Молекулярная и клеточная неврология. 50 (1): 35–44. Дои:10.1016 / j.mcn.2012.03.004. ЧВК  3631567. PMID  22449939.
10. Рикар, Джером; Джессика Салинас; Лиссетт Гарсия; Даниэль Дж. Либл (2006). «EphrinB3 регулирует пролиферацию и выживание клеток в нейрогенезе взрослых». Молекулярная и клеточная неврология. 31 (4): 713–22. Дои:10.1016 / j.mcn.2006.01.002. PMID  16483793. S2CID  206830930.

дальнейшее чтение

• Фланаган Дж. Г., Вандерхэген П. (1998). «Эфрины и рецепторы Eph в нервном развитии». Анну. Преподобный Neurosci. 21: 309–45. Дои:10.1146 / annurev.neuro.21.1.309. PMID  9530499.
• Чжоу Р. (1998). «Рецепторы и лиганды семейства Eph». Pharmacol. Ther. 77 (3): 151–81. Дои:10.1016 / S0163-7258 (97) 00112-5. PMID  9576626.
• Держатель N, Klein R (1999). «Рецепторы Eph и эфрины: эффекторы морфогенеза». Развитие. 126 (10): 2033–44. PMID  10207129.
• Уилкинсон Д.Г. (2000). «Рецепторы Eph и эфрины: регуляторы наведения и сборки». Int. Преподобный Цитол. Международный обзор цитологии. 196: 177–244. Дои:10.1016 / S0074-7696 (00) 96005-4. ISBN  978-0-12-364600-2. PMID  10730216.
• Сюй Кью, Меллитцер Г., Уилкинсон Д.Г. (2001). «Роль рецепторов Eph и эфринов в сегментарном формировании паттерна». Филос. Пер. R. Soc. Лондон. B Biol. Наука. 355 (1399): 993–1002. Дои:10.1098 / rstb.2000.0635. ЧВК  1692797. PMID  11128993.
• Уилкинсон Д.Г. (2001). «Множественные роли рецепторов EPH и эфринов в развитии нервной системы». Nat. Преподобный Neurosci. 2 (3): 155–64. Дои:10.1038/35058515. PMID  11256076. S2CID  205014301.
• Гейл Н.В., Фленникен А., Комптон, округ Колумбия, и др. (1996). «Elk-L3, новый трансмембранный лиганд для семейства рецепторных тирозинкиназ Eph, экспрессируемый в пластинке дна эмбриона, пластине крыши и сегментах заднего мозга». Онкоген. 13 (6): 1343–52. PMID  8808709.
• Эфноменклатурный комитет (1997). «Единая номенклатура рецепторов семейства Eph и их лигандов, эфринов. Комитет по номенклатуре Eph». Ячейка. 90 (3): 403–4. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80500-0. PMID  9267020. S2CID  26773768.
• Бергеманн А.Д., Чжан Л., Чан М.К. и др. (1998). «Эфрин-B3, лиганд рецептора EphB3, экспрессируемый по средней линии развивающейся нервной трубки». Онкоген. 16 (4): 471–80. Дои:10.1038 / sj.onc.1201557. PMID  9484836.
• Брюкнер К., Пабло Лабрадор Дж., Шайффеле П. и др. (1999). «Лиганды EphrinB рекрутируют адаптерные белки PDZ семейства GRIP в микродомены мембран рафта». Нейрон. 22 (3): 511–24. Дои:10.1016 / S0896-6273 (00) 80706-0. PMID  10197531.
• Лю В., Ахмад С.А., Юнг Ю.Д. и др. (2002). «Коэкспрессия эфрина-B и их рецепторов при карциноме толстой кишки». Рак. 94 (4): 934–9. Дои:10.1002 / cncr.10122. PMID  11920461. S2CID  25734266.
• Такемото М., Фукуда Т., Сонода Р. и др. (2002). «Взаимодействия эфрин-B3-EphA4 регулируют рост специфических популяций таламокортикальных аксонов in vitro». Евро. J. Neurosci. 16 (6): 1168–72. Дои:10.1046 / j.1460-9568.2002.02166.x. PMID  12383247. S2CID  7540058.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.