Гаплогруппа K2b (Y-ДНК) - Haplogroup K2b (Y-DNA)

Гаплогруппа K2b (P331)
Возможное время происхожденияПримерно на 3000 лет моложе K-M9 возрастом от 40 000 до 50 000 лет
Возможное место происхожденияНаверное Юго-Восточная Азия[1] или же Южная Азия.[1]
ПредокK2
Потомки
  • K2b1 (ранее известный как РС) и;
  • Гаплогруппа P (K2b2; субклады включают гаплогруппы Q и R).
Определение мутацийP331, CTS2019 / M1205, PF5990 / L405, PF5969,[2][3]

Гаплогруппа K2b (P331), также известный как MPS[2] человек y-хромосома гаплогруппа считается, что он менее чем на 3000 лет моложе K и менее чем на 10 000 лет моложе F, что означает, что, согласно оценкам возраста Татьяны Карафет и др., ему, вероятно, около 50 000 лет. 2014 г.[1]

Базальный K2b * не обнаружен у живых самцов. Он был найден только в останках человека, известного как Тяньюань человек,[4] кто был жив где-то между 42000 и 39000 лет BP, вовремя верхний палеолит эпохи, недалеко от будущего сайта Пекин, Китай. (Какое-то время базальная клада ошибочно приписывалась другому человеку, известному как RISE94, который жил 3000 лет назад на территории современной Швеции. Тем не мение, RISE94 теперь известно, что принадлежит R1a.)

K2b1 (P397 / P399), ранее известный как Гаплогруппа MS, и Гаплогруппа P (P-P295), также известный как K2b2 являются единственными первичными кладами K2b. Популяционный генетик Татьяна Карафет и другие исследователи (2014) отмечают, что K2b1, его субклады и P * фактически ограничены географически Юго-Восточная Азия и Океания.[1] Между тем, в разительном контрасте P1 (P-M45) и его основные субклады Q и р теперь составляют «самую частую гаплогруппу в Европа, то Америка, и Центральная Азия и Южная Азия Согласно Карафету и др., Предполагаемые даты ветвления K, K2, K2b и P указывают на «быструю диверсификацию» в пределах K2, «которая, вероятно, произошла в Юго-Восточной Азии», с последующим «расширением на запад» P * , P1, Q и R.[1]

Филогенетическая структура

Основная статья: Структура Y-ДНК гаплогруппы K
  • K2b (P331), также известный как MPS.
    • K2b1 (P397, P399), аналогично предыдущей гаплогруппе MS.
    • Гаплогруппа P (P295 / PF5866 / S8) - также известен как K2b2.
      • P1 (M45) - также известен как K2b2a; потомки субкладов включают основные гаплогруппы Q и р.

Распределение

Базальный K2b * найден в верхнем палеолите. Тяньюань человек из Китая,[4] современные популяции с живыми членами непосредственных субкладов K2b1 * и P * (K2b2), по-видимому, поляризованы между Океания, Южная Азия и восточный Сибирь.

Немного Негрито популяции Юго-Восточной Азии несут очень высокие уровни K2b на уровне субклада. Его переносят, например, более 83% мужчин среди Aeta (или агта) народ Филиппин, в форме K2b1 (60%), П* (P-P295 *, он же K2b2 *) и P2 (P-B253; K2b2b).

K2b1

K2b1 встречается у 83% мужчин в Папуа-Новой Гвинее и до 60% в Люди Aeta из Филиппины.[5] Он также встречается среди других Меланезийский населения, а также коренные австралийцы, и на более низких уровнях среди Полинезийцы.[5]

Основные исследования коренные австралийцы Y-ДНК, опубликованные в 2014 и 2015 годах, предполагают, что около 29% коренные австралийцы самцы принадлежат к субкладам K2b1. То есть до 27% мужчин из числа коренных жителей Австралии несут гаплогруппу. S1a1a1 (S-P308; ранее известный как K2b1a1 или K-P308),[5] и одно исследование показало, что примерно 2,0% - то есть 0,9% (11 человек) выборки в исследовании, в котором 45% от общего числа считались некоренными - принадлежали к гаплогруппе. M1 (M-M4; также известный как M-M186 и ранее известный как гаплогруппа K2b1d1). Все эти самцы, несущие M1, были Жители островов Торресова пролива.[6] (Другими найденными гаплогруппами Y-ДНК были: базальная K2 * [K-M526], C1b2b [M347; ранее гаплогруппа C4] и базальная C * [M130].)

численность населенияK2b1 (включая гаплогруппы M & S)
Папуа - Новая Гвинея82.76%
маори03,82% (1,95% опрошенных, т.е. 49% мужчин маори имели некоренную Y-ДНК)
Фиджи60.75%
Соломоновы острова71.9%
Французская Полинезия08%
Вануату76.5%
Новая Каледония
Гуам33,3% (небольшой размер выборки)
Самоа08.04%
Кирибати00% (небольшой размер выборки)
Тонга20.69%
Микронезия FDR66.67%
Маршалловы острова63.64%
американское Самоа
Северные Марианские острова
Палау61,5% (небольшой размер выборки)
Острова Кука03.9%
Уоллис и Футуна26%
Тувалу36%
Науру28,6% (небольшой размер выборки)
Остров Норфолк
Ниуэ00% (небольшой размер выборки)
Токелау50% (небольшой размер выборки)
Гавайи20% (небольшой размер выборки из FTDNA)
Австралийские аборигены29%[6]
Тимор25%
Aeta60%
малайский02,4% (небольшой размер выборки)
Флорес35%
Сулавеси11.3%
Восточная Индонезия (Малые Зондские острова)25.9%
Ява Индонезия00%
Бали Индонезия00.9%
Суматра Индонезия00%
Борнео Индонезия05.8%
Западное Папуа (Провинция Папуа, Индонезия)52.6%
Западное Папуа (Провинция Папуа, Индонезия)82.6%
Сумба Индонезия25.2%
Чуккский народ Микронезия76.5%
Понпейский люди Микронезия70% (небольшой размер выборки)

П (K2b2)

Помимо базальной парагруппы П * (K2b2), у него есть только один подклад: P1 (M45), также известный как K2b2a, который также является родителем основных гаплогрупп Q (K2b2a1) и R (K2b2a2).[1]

Потомки P (K2b2) гаплогрупп Q (K2b2a1) и R (K2b2a2) широко распространены среди мужчин Коренной американец, Среднеазиатский, Южная Азия и Европейский происхождение.

Базальный P * (K2b2 *)

P-P295 * (иногда известный как «pre-P», прежде чем P-M45 был переименован в P1) встречается у 28% мужчин среди Aeta, а также в Тимор на 10,8%, и один случай мог быть обнаружен в Папуа - Новая Гвинея (Kaysar et al. 2006), хотя это не было подтверждено.[5]

численность населенияСтавка P * (%)Примечания
Папуа - Новая Гвинея0.69предполагается из Kayser et al. 2006 г., т.е. найден один P *
Новая Зеландия0
Фиджи0
Соломоновы острова0
Французская Полинезия0
Вануату0
Новая Каледония
Гуам0
Самоа0
Кирибати
Тонга0
Федеративные Штаты Микронезии0
Маршалловы острова0
американское Самоа
Северные Марианские острова
Палау
Острова Кука0
Уоллис и Футуна0
Тувалу0
Науру
Остров Норфолк
Ниуэ0небольшой размер выборки
Токелау0небольшой размер выборки
Гавайи0небольшой размер выборки из FTDNA
Австралия0
Тимор10.8
Aeta28
Филиппинский австронезийский0
малайский0
Флорес0
Сулавеси0.6
Восточная Индонезия0
Ява Индонезия0
Бали Индонезия0
Суматра Индонезия0
Борнео Индонезия0
Провинция Западное Папуа0
Провинция Папуа0
Сумба Индонезия3.2

P1 (K2b2a)

P1 (M45 / PF5962), также известный как K2b2a, в сотни раз более распространен, чем P * (K2b2; PxM45), поскольку он включает гаплогруппы Q и R, по оценкам, на 14 300 лет моложе, чем K2b.[5]

Многие этнические группы с высокой частотой P1 расположены в Центральная Азия и Сибирь: 35,4% среди Тувинцы, 28,3% среди Алтайский Кижи,[7] и 35% среди Нивхский самцы.

В современных популяциях Южной Азии также присутствует P1 с низкой или средней частотой.[8] В Южной Азии это чаще всего встречается у мусульман Манипур (33%), но это может быть связано с очень маленьким размером выборки (девять человек). Случаи P1 (M45), зарегистрированные в Южной Азии, могут быть неразрешенными случаями либо R2 или Q.[8]

Группа населения (с этнолингвистическая принадлежность)БумагаNПроцентSNP протестированы
Тувинский (Тюркский)Даренко 200511335.40П-М45
Нивхский (изолировать)Лелл 20011735П-М45
Алтай-Кижи (Алтайцы ) (Тюркский)Даренко 20059228.3П-М45
Тоджин (Тюркский)Даренко 20053622.2П-М45
Чукча (Чукотканский)Лелл 20012420.8П-М45
Коряк (Чукотканский)Лелл 20012718.5П-М45
Юпик (Эскимо-алеутский)Лелл 20013318.2П-М45
Уйгурский (Тюркский)Сюэ 20067017.1П-М45
Калмыцкий (Монгольский)Даренко 20056811.8П-М45
туркменский (Тюркский)Уэллс 20013010П-М45
Сойот (Тюркский)Даренко 2005348.8П-М45
Урянхай (Монгольский)Като 2004608.3П-М45
Хакасский (Тюркский)Даренко 2005537.6П-М45
Казахский (Тюркский)Уэллс 2001545.6П-М45
Узбекский (Тюркский)Уэллс 20013665.5П-М45
Хаси-Хмуик (Австро-азиатский)Редди 20093535.40P-M45 (xM173) §
Мундари (Австро-азиатский)Редди 20096410.90P-M45 (xM173) §
Никобарцы (Пн-кхмерский)Редди 2009110.00P-M45 (xM173) §
Юго-Восточная Азия (Австро-азиатский )Редди 20092571.60P-M45 (xM173) §
Гаро (Тибето-бирманский)Редди 2009711.40P-M45 (xM173) §
Индия (Тибето-бирманский )Редди 20092263.10P-M45 (xM173) §
Восточная Азия (Тибето-бирманский)Редди 20092140.00P-M45 (xM173) §
Восточная Индия (Индоевропейский )Редди 20095418.50P-M45 (xM173) §
Иран (Южный Талышский )Насидзе 2009 г.504.00P-M45 (xM124, xM173)
Азербайджан (Северный Талышский )Насидзе 2009 г.405.00P-M45 (xM124, xM173)
Мазандарани (Иранский)Насидзе 2009 г.504.00P-M45 (xM124, xM173)
Гилаки (Иранский)Насидзе 2009 г.500.00P-M45 (xM124, xM173)
Тегеран (Иранский)Насидзе 2004 г.804.00P-M45 (xM124, xM173)
Исфахан (Иранский)Насидзе 2004 г.506.00P-M45 (xM124, xM173)
Бахтиари (Иранский)Насидзе 2008532.00P-M45 (xM124, xM173)
Иранские арабы (арабский)Насидзе 2008472.00P-M45 (xM124, xM173)
Северный Иран (Иранский)Регейро 2006339.00P-M45 (xM124, xM173)
Южный Иран (Иранский)Регейро 20061173.00P-M45 (xM124, xM173)
Южный Кавказ (Грузинский )Насидзе и Стоункинг 2001773.00P-M45 (xM124, xM173)
Южный Кавказ (Армянский )Насидзе и Стоункинг 20011002.00P-M45 (xM124, xM173)
Хвар (хорватский )Барак и др. 2003 г.14
Корчула (хорватский )Барак и др. 2003 г.6

§ Сюда могут входить члены гаплогруппы. R2.

Группа населенияNP (xQ, xR)QрБумага
Считать%Считать%Считать%
Gope1616.4Sahoo 2006
Ория брамин2414.2Sahoo 2006
Махишья17317.6Sahoo 2006
Бумидж15213.3Sahoo 2006
Саора13323.1Sahoo 2006
Непальский7228.6Sahoo 2006
Мусульмане Манипура9333.3Sahoo 2006
Химачал-Прадеш, Раджпут1516.7Sahoo 2006
Ламбади18422.2Sahoo 2006
Гуджаратский Патель9222.2Sahoo 2006
Каткари1915.3Sahoo 2006
Мадиа Гонд1417.1Sahoo 2006
Камма Чоудари150016.71280Sahoo 2006

Смотрите также

  • Гаплогруппы древних популяций предполагаются на основе небольших размеров древней выборки.
    • † Обозначает предполагаемое вымирание (нет живого образца той же гаплогруппы)
      • [9] Вся флогения, за исключением распределения Hg X + клады K2b1, клады K2 * и K2c + K2d, а также P (xm45)

[16][17][18][19][20][21][22][23][24][25][26] Современное население + древние баски

  • [2][27] у-днк гаплогруппа X.

______________________________________________________________________________________________________________

Рекомендации

  1. ^ а б c d е ж Татьяна Михайловна Карафет и все. Улучшенное филогенетическое разрешение и быстрая диверсификация гаплогруппы Y-хромосомы K-M526 в Юго-Восточной Азии, 2014 г.
  2. ^ а б c "PhyloTree y - минимальное y дерево".
  3. ^ Карафат 2014
  4. ^ а б «Загружаемые генотипы современных и древних данных ДНК (составлены из опубликованных статей) | Лаборатория Дэвида Райха». reich.hms.harvard.edu. Получено 2019-09-11.
  5. ^ а б c d е Карафет 2014
  6. ^ а б Nagle, N. et al., 2015, "Древность и разнообразие Y-хромосом австралийских аборигенов", Американский журнал физической антропологии (epub перед версией для печати; Абстрактные ).
  7. ^ Мирослава Деренко и др. 2005, Контрастные паттерны вариации Y-хромосомы в популяциях Южной Сибири из Байкальского и Алтае-Саянского регионов
  8. ^ а б Саху, С. (2006). «Предыстория индийских Y-хромосом: оценка сценариев демической диффузии». Труды Национальной академии наук. 103 (4): 843–8. Bibcode:2006ПНАС..103..843С. Дои:10.1073 / pnas.0507714103. ЧВК  1347984. PMID  16415161.
  9. ^ Карафет, Татьяна М .; Mendez, Fernando L .; Судойо, Херавати; Лансинг, Дж. Стивен; Хаммер, Майкл Ф. (2015). «Улучшенное филогенетическое разрешение и быстрая диверсификация гаплогруппы Y-хромосомы K-M526 в Юго-Восточной Азии». Европейский журнал генетики человека. 23 (3): 369–373. Дои:10.1038 / ejhg.2014.106. ЧВК  4326703. PMID  24896152.
  10. ^ Рагхаван, Маанаса; Скоглунд, Понт; Graf, Kelly E .; Мецпалу, Майт; Альбрехтсен, Андерс; Мольтке, Ида; Расмуссен, Саймон; Стаффорд-младший, Томас У .; Орландо, Людовик; Мецпалу, Эне; Кармин, Моника; Тамбец, Кристина; Рутси, Сиири; Мяги, Ридик; Кампос, Паула Ф .; Балановская, Елена; Балановский, Олег; Хуснутдинова Эльза; Литвинов, Сергей; Осипова, Людмила П .; Федорова, Сардана А .; Воевода, Михаил И .; Деджоржио, Майкл; Зихериц-Понтен, Томас; Брунак, Сорен; Демещенко, Светлана; Кивисилд, Тоомас; Виллемс, Ричард; Нильсен, Расмус; и другие. (2014). «Верхний палеолитический геном Сибири показывает двойное происхождение коренных американцев». Природа. 505 (7481): 87–91. Bibcode:2014Натура.505 ... 87р. Дои:10.1038 / природа12736. ЧВК  4105016. PMID  24256729.
  11. ^ Расмуссен, Мортен; Анзик, Сара Л .; Waters, Michael R .; Скоглунд, Понт; Деджоржио, Майкл; Стаффорд, Томас У .; Расмуссен, Саймон; Мольтке, Ида; Альбрехтсен, Андерс; Дойл, Шейн М .; Позник, Г. Давид; Гудмундсдоттир, Вальборг; Ядав, Рачита; Маласпинас, Анна-Сапфо; V, Сэмюэл Стоктон Уайт; Аллентофт, Мортен Э .; Cornejo, Omar E .; Тамбец, Кристина; Эрикссон, Андерс; Хайнцман, Питер Д .; Кармин, Моника; Корнелиуссен, Торфинн Санд; Мельцер, Дэвид Дж .; Pierre, Tracey L .; Стендеруп, Джеспер; Сааг, Лаури; Вармут, Вера М .; Лопес, Маргарида С .; Malhi, Ripan S .; и другие. (2014). "Геном человека позднего плейстоцена из захоронения Хлодвига в западной Монтане". Природа. 506 (7487): 225–229. Bibcode:2014Натура.506..225R. Дои:10.1038 / природа13025. ЧВК  4878442. PMID  24522598.
  12. ^ Hollard, C .; Keyser, C .; Giscard, P.H .; Цагаан, Т .; Баярхуу, Н .; Bemmann, J .; Crubézy, E .; Лудес, Б. (2014). «Сильная генетическая примесь на Алтае в эпоху средней бронзы, выявленная по информативным маркерам однопородности и предков». Международная криминалистическая экспертиза. Генетика. 12: 199–207. Дои:10.1016 / j.fsigen.2014.05.012. PMID  25016250.
  13. ^ http://www.biomedcentral.com/content/pdf/1471-2148-9-181.pdf
  14. ^ Гругни, Альт; Батталья, Винченца; Хушиар Кашани, Бахарак; Пароло, Сильвия; Аль-Захери, Надия; Ахилли, Алессандро; Оливьери, Анна; Гандини, Франческа; Хушманд, Масуд; Санати, Мохаммад Хоссейн; Торрони, Антонио; Семино, Орнелла (2012). «Древние миграционные события на Ближнем Востоке: новые ключи к изменению Y-хромосомы современных иранцев». PLOS ONE. 7 (7): e41252. Bibcode:2012PLoSO ... 741252G. Дои:10.1371 / journal.pone.0041252. ЧВК  3399854. PMID  22815981.
  15. ^ http://www.press.uchicago.edu/ucp/journals/journal/ca.html
  16. ^ Габер, Марк; Platt, Daniel E .; Ашрафиан Бонаб, Мазиар; Юханна, Соня С .; Сориа-Эрнанц, Дэвид Ф .; Мартинес-Крус, Бегонья; Дуайхи, Бушра; Гассиб-Саббаг, Мишелла; Рафатпанах, Хошанг; Ганбари, Мохсен; Кит, Джон; Балановский, Олег; Уэллс, Р. Спенсер; Комас, Дэвид; Тайлер-Смит, Крис; Заллуа, Пьер А. (2012). «Этнические группы Афганистана разделяют наследие Y-хромосомы, структурированное историческими событиями». PLOS ONE. 7 (3): e34288. Bibcode:2012PLoSO ... 734288H. Дои:10.1371 / journal.pone.0034288. ЧВК  3314501. PMID  22470552.
  17. ^ Бекада, Асмахан; Фрегель, Роза; Cabrera, Vicente M .; Ларруга, Хосе М .; Пестано, Хосе; Бенхамамуш, Сорайя; Гонсалес, Ана М. (2013). «Представление алжирской митохондриальной ДНК и Y-хромосомы профилей в ландшафте Северной Африки». PLOS ONE. 8 (2): e56775. Bibcode:2013PLoSO ... 856775B. Дои:10.1371 / journal.pone.0056775. ЧВК  3576335. PMID  23431392.
  18. ^ Россер, З. Х .; Зерджал, Т; Hurles, M.E .; Адохаан, М; Алавантик, Д; Аморим, А; Амос, Вт; Арментерос, М; Арройо, Э; Barbujani, G; Бекман, G; Бекман, L; Bertranpetit, J; Bosch, E; Bradley, D.G .; Бреде, G; Купер, G; Côrte-Real, H.B .; Де Книжфф, П; Decorte, R; Дуброва, Ю.Е .; Евграфов, О; Гилиссен, А; Glisic, S; Gölge, M; Hill, E.W .; Jeziorowska, A; Калайджиева, Л; Кайзер, М; и другие. (Декабрь 2000 г.). «Разнообразие Y-хромосомы в Европе является клинальным и определяется в первую очередь географией, а не языком». Американский журнал генетики человека. 67 (6): 1526–43. Дои:10.1086/316890. ЧВК  1287948. PMID  11078479.
  19. ^ Генетическая структура современных изолированных популяций Южного Тироля, выявленная с помощью анализа полиморфизмов Y-хромосомы, мтДНК и Alu
  20. ^ STR-гаплотипы Y-хромосомы в выборке населения из континентальной Греции и островов Крит и Хиос
  21. ^ http://www.krepublishers.com/06-Special%20Volume-Journal/T-Anth-00-Special%20Volumes/T-Anth-SI-03-Anth-Today-Web/Anth-SI-03-31- Триведи-Р / Anth-SI-03-31-Триведи-R-Tt.pdf
  22. ^ Хирбо, Джибрил Бору (2011). "Комплексная генетическая история популяций человека в Восточной Африке". Цитировать журнал требует | журнал = (помощь)
  23. ^ Sanchez, J.J .; Børsting, C .; Эрнандес, А .; Mengel-Jørgensen, J .; Морлинг, Н. (2004). «Гаплогруппы SNP Y хромосомы у датчан, гренландцев и сомалийцев». Серия международных конгрессов. 1261: 347–349. Дои:10.1016 / S0531-5131 (03) 01635-2.
  24. ^ Cruciani, F; Тромбетта, B; Селлитто, Д; Massaia, A; Дестро-Бизоль, Г; Watson, E; Beraud Colomb, E; Dugoujon, J.M .; Мораль, P; Скоццари, Р. (июль 2010 г.). «Гаплогруппа Y-хромосомы человека R-V88: отцовский генетический отчет о транссахарских связях в начале среднего голоцена и распространении чадских языков». Европейский журнал генетики человека. 18 (7): 800–7. Дои:10.1038 / ejhg.2009.231. ЧВК  2987365. PMID  20051990.
  25. ^ yhrd.org
  26. ^ Чжун, H .; Ши, Х .; Ци, X.-B .; Duan, Z.-Y .; Tan, P.-P .; Jin, L .; Вс, Б .; Ма, Р. З. (2011). «Расширенное исследование y-хромосомы предполагает постледниковые миграции современного человека в Восточную Азию по северному пути». Молекулярная биология и эволюция. 28 (1): 717–727. Дои:10.1093 / molbev / msq247. PMID  20837606.
  27. ^ . 2013-12-13. bioRxiv  10.1101/000802. Отсутствует или пусто | название = (помощь)

Примечания

[Принимая B70 тыс. Лет для TMRCA хромосом M168, 10 мы оцениваем интервал времени между диверсификацией K-M9 и K-P331 как <3 тыс. Лет назад. Эта быстрая диверсификация была также оценена с использованием данных о полной последовательности Y-хромосомы.22 Кроме того, мы оцениваем общее время между общим предком K-M9 и P-P295 как <5 тыс. Лет, а время между общим предком P-P295 а для P-P27 - 12,3 тыс. лет (95% ДИ: 6,6–20 тыс. лет).http://www.nature.com/ejhg/journal/vaop/ncurrent/full/ejhg2014106a.html ]

Филогенетическое древо человека Гаплогруппы ДНК Y-хромосомы [χ 1][χ 2]
"Y-хромосомный Адам "
A00A0-T  [χ 3]
A0A1  [χ 4]
A1aA1b
A1b1BT
BCT
DECF
DECF
F1 F2 F3 GHIJK
граммHIJK
IJKЧАС
IJK
я   J     LT  [χ 5]      K2 [χ 6]
L     Т    K2a  [χ 7]       K2b [χ 8]    K2c    K2dK2e  [χ 9]  
K-M2313 [χ 10]    K2b1 [χ 11]п  [χ 12]
НЕТ  S  [χ 13] M  [χ 14]   P1    P2
NОQр