Малая ядрышковая РНК SNORA40 - Small nucleolar RNA SNORA40

Малая ядрышковая РНК SNORA40
RF00561.jpg
Идентификаторы
СимволСНОРА40
Альт. СимволыsnoACA40
РфамRF00561
Прочие данные
РНК типГен; мяРНК; snoRNA; HACA-бокс
Домен (ы)Эукариоты
ИДТИТермин GO должен начинаться с GO: Термин GO должен начинаться с GO:
ТАКТАК: 0000594
PDB структурыPDBe

В малая ядрышковая РНК ACA40 принадлежит к Семейство мяРНК H / ACA и направляет псевдоуридилирование из 28S рРНК субъединица в позиции U4565. snoRNA ACA40 была обнаружена с использованием крупномасштабных клонирование по Kiss et al. (2004)[1] из HeLa клеточный экстракт, иммунопреципитированный антителом против GAR1. Прогнозируется, что псевдоуридилирование остатков 28S рРНК U4546 и 18S рРНК 1174.[1][2] О псевдоуридилировании этих остатков сообщили Ofengand и Bakin (1997).[3] и Маден (1990).[4] ACA1, ACA8, ACA18, ACA25, ACA32 и ACA40 и C / D-бокс snoRNAs mgh28S-2409 и mgh28S-2411 имеют один и тот же ген хозяина (MGC5306).

Рекомендации

  1. ^ а б Поцелуй, Арнольд М .; Jády, Beáta E .; Бертран, Эдуард; Поцелуй, Тамаш (2004). "Human Box H / ACA Pseudouridylation Guide RNA Machinery". Молекулярная и клеточная биология. 24 (13): 5797–5807. Дои:10.1128 / MCB.24.13.5797-5807.2004. ЧВК  480876. PMID  15199136.
  2. ^ Шаттнер П., Барберан-Солер С., Лоу TM (2006). «Вычислительный экран для руководства по псевдоуридилированию H / ACA РНК млекопитающих». РНК. 12 (1): 15–25. Дои:10.1261 / rna.2210406. ЧВК  1370881. PMID  16373490.
  3. ^ Офенганд, Дж; Бакин А (1997). «Картирование нуклеотидного разрешения остатков псевдоуридина в рибосомных РНК большой субъединицы из репрезентативных эукариот, прокариот, архебактерий, митохондрий и хлоропластов». Дж Мол Биол. 266 (2): 246–268. Дои:10.1006 / jmbi.1996.0737. PMID  9047361.
  4. ^ Маден Б.Е. (1990). «Многочисленные модифицированные нуклеотиды в рибосомной РНК эукариот». Прог. Nucleic Acid Res. Мол. Биол. 39: 241–303. Дои:10.1016 / S0079-6603 (08) 60629-7. PMID  2247610.

внешняя ссылка