Малая ядрышковая РНК SNORD62 - Small nucleolar RNA SNORD62

Малая ядрышковая РНК SNORD62
RF00153.jpg
Идентификаторы
СимволSNORD62
Альт. СимволыU62
РфамRF00153
Прочие данные
РНК типГен; мяРНК; snoRNA; C / D-бокс
Домен (ы)Эукариоты
ИДТИТермин GO должен начинаться с GO: Термин GO должен начинаться с GO:
ТАКТАК: 0000593
PDB структурыPDBe

snoRNA U62 (также известен как SNORD62) это некодирующая РНК (нкРНК) молекула, которая функционирует в модификации других малые ядерные РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно находится в ядрышко эукариотической клетки, которая является основным участком биогенеза мяРНК. Он известен как малая ядрышковая РНК (snoRNA) и также часто упоминается как направляющая РНК.

snoRNA U62 принадлежит к C / D коробка класс snoRNA, которые содержат консервативные мотивы последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства боксов C / D действуют в направлении сайт-специфичных 2'-O-метилирование субстратных РНК.[1]

В геноме человека есть две идентичные копии мяРНК U62 (называемые U62A и U62B), обе из которых расположены в пределах интроны того же гена-хозяина, который кодирует гипотетический белок (KIAA0515).[2]Предполагается, что U62 руководит метилированием 2'O-рибозы 18S. рибосомная РНК (рРНК) находятся в A590.[3]

Рекомендации

  1. ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (октябрь 2002 г.). «Очищенные бокс-C / D snoRNP способны воспроизводить сайт-специфичное 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro». Молекулярная и клеточная биология. 22 (19): 6663–8. Дои:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. ЧВК  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Tycowski KT, Smith CM, Shu MD, Steitz JA (декабрь 1996 г.). «Требование малой ядрышковой РНК для сайт-специфического метилирования рибозы рРНК у Xenopus». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 93 (25): 14480–5. Дои:10.1073 / пнас.93.25.14480. ЧВК  26158. PMID  8962077.
  3. ^ Лестрейд Л., Вебер М.Дж. (январь 2006 г.). "snoRNA-LBME-db, всеобъемлющая база данных человеческих H / ACA и C / D box snoRNAs". Исследования нуклеиновых кислот. 34 (Проблема с базой данных): D158-62. CiteSeerX  10.1.1.105.7552. Дои:10.1093 / nar / gkj002. ЧВК  1347365. PMID  16381836.

внешняя ссылка